利用5个光温敏核不育系与40个恢复系（品种）配制了200个组合，应用SSR标记估算了这5个不育系与40个恢复系之间的遗传距离，分析了遗传距离与杂种优势的关系。结果表明：（1）不同材料、不同遗传距离范围之间，遗传距离与单株产量以及有效穗数、穗长、每穗粒敷、着粒密度、结实率、千粒重、单株产量7个性状超亲优势的相关性有很大差别，表现出很复杂的关系。（2）田丰S与父本遗传距离在0．6286～2．5257之间时，F1单株产量及其超亲优势与遗传距离极显著相关；培矮64S与父本遗传距离在0．8247～1．5315之间时，F1单株产量与遗传距离显著相关。（3）所有两系组合亲本间遗传距离在0．5333～1．5之间时，F1单株产量超亲优势与遗传距离显著相关；遗传距离在0．5333～1．0之间时，F1单株产量与遗传距离显著相关，遗传距离分别在1．0～1．5、0．5333～1．5和0．5333～2．5257之间时极显著相关。（4）另外，F1单株产量与遗传距离的相关程度普遍高于其超亲优势与遗传距离的相关程度。