生物信息学预测植物miRNAs的方法
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现代农业产业技术体系建设专项资金资助(CARS-14);山东省现代农业产业技术体系项目;山东省农业


Bioinformatics Prediction of MicroRNAs in Plant
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    MicroRNA,又称miRNA,是一类广泛存在于动植物体内、大小为21~25nt左右的内源性非编码单链小分子RNA。在植物体中,miRNA主要负责调控转录后基因的表达,在机体发育、生长和应答胁迫方面发挥着重要的调节作用。近年来,miRNA已成为分子生物学领域的研究热点。本文介绍了几种发现和研究miRNA的方法,重点阐述了生物信息学预测miRNA方法的流程和策略,并对各过程中采用的方法及信息学软件的优劣性进行比较和分析,为预测miRNA提供新的思路。

    Abstract:

    MicroRNAs (miRNAs) are endogenous non-coding single-strand molecules with 21-25 nucleotides in length, and they are widely existed in plants and animals. In plant, miRNAs have been confirmed that they negatively regulate gene expression negatively at the post-transcriptional level and play an important regulatory role in plant growth and development, and response to various biotic and abiotic stress. In recent years, miRNA has become the hotspot in modern molecule biology. In this paper, several methods for identification and charactrization of plant miRNAs were introduced, and further the processes and strategies for miRNA bioinformatics prediction were reviewed with emphasis, as well as investigation and analysis of some bioinformatics softwares. This paper will provide new ideas for miRNA identification in plant.

    参考文献
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    引证文献
引用本文

张廷婷,胡述浩,单世华,等.生物信息学预测植物miRNAs的方法[J].植物遗传资源学报,2015,16(1):147-150.

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  • 收稿日期:2014-03-07
  • 最后修改日期:2014-06-27
  • 录用日期:2014-12-11
  • 在线发布日期: 2015-01-04
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