2025年5月13日 2:51 星期二
  • 网站首页
  • 期刊简介
  • 投稿指南
    投稿指南
    论文模版
    著作权许可及转让声明
  • 编委会
    植物遗传资源学报编委会
    青年编委
    主编简介
  • OA政策
    OA政策
    情况通报
    高被引论文
  • 出版伦理
    出版伦理声明
  • 遗传资源分会
    遗传资源分会简介
    委员会
    活动公告
    成为会员
  • 欢迎订阅
  • 联系我们
  • English
  • 微信公众号
首页 > 过刊浏览>年第0卷第6期 > 优先出版
PDF HTML阅读 XML下载 导出引用 引用提醒
基于BSA-seq和GWAS技术的豇豆花色基因定位分析
DOI:
CSTR:
作者:
  • 胡格格

    胡格格

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 朱姝萌

    朱姝萌

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 苏晓佳

    苏晓佳

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 康研

    康研

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 刘明慧

    刘明慧

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 郭瑞

    郭瑞

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 潘磊

    潘磊

    江汉大学
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
作者单位:

江汉大学

作者简介:

通讯作者:

中图分类号:

基金项目:

国家自然科学基金项目(面上项目,重点项目,重大项目)


Localisation analysis of cowpea flower color genes based on BSA-seq and GWAS techniques
Author:
  • HU Gege

    HU Gege

    Jianghan University
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找

  • 在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
Affiliation:

Jianghan University

Fund Project:

The National Natural Science Foundation of China (General Program, Key Program, Major Research Plan)

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    豇豆(Vigna unguiculata)是主要豆科农作物之一,广泛分布在全球的热带和亚热带地区,我国各地均有种植。豇豆花色是一种重要农艺性状,在其繁殖过程中发挥着重要作用,但是豇豆花色变异的分子遗传基础尚不清楚。为此,本研究采用基于重组自交系(RILs)群体花色的BSA-seq分析与豇豆自然群体(271份)花色的全基因组关联分析(GWAS)相结合,将控制花色的基因定位于第九号染色体上31.9 Mb至32.3 Mb之间(0.4 Mb区域)。分析表明该0.4 Mb区域包含30个基因,其中TRANSPARENT TESTA GLABRA 1(TTG1)基因位于SNP-index峰值附近,且在拟南芥中参与调控花青素的生物合成。进一步采用实时荧光定量PCR(RT-PCR)分析发现,紫色和白色的旗瓣在TTG1的基因表达存在显著差异。此外,在该区域内筛选出2对多态性SSR引物,能够区分RIL群体中紫色和白色旗瓣个体。本研究结果可为豇豆花色遗传变异和分子育种提供一定的理论依据。

    关键词:豇豆;花色;BSA-seq;全基因组关联分析;分子标记
    Abstract:

    Cowpea (Vigna unguiculata) is one of the major legume crops, widely distributed in tropical and subtropical regions of the world, and grown throughout China. Cowpea flower color is an important agronomic trait that plays an important role in its reproduction, but the molecular genetic basis of cowpea flower color variation is not known. To this end, this study used a combination of BSA-seq analysis based on flower color in a population of recombinant inbred lines (RILs) and genome-wide association analysis (GWAS) of flower color in a natural population of cowpea (271 accessions), which located the gene controlling flower color between 31.9 Mb and 32.3 Mb on chromosome IX (0.4 Mb region). The analysis showed that this 0.4-Mb region contains 30 genes, among which the TRANSPARENT TESTA GLABRA 1 (TTG1) gene is located near the peak of SNP-index and is involved in the regulation of anthocyanin biosynthesis in Arabidopsis. Further analysis using real-time fluorescence quantitative PCR (RT-PCR) revealed that there was a significant difference in gene expression of TTG1 between purple and white flag petals. In addition, two pairs of polymorphic SSR primers were screened within this region and were able to distinguish between purple and white flag petal individuals in the RIL population. The results of this study can provide some theoretical basis for cowpea flower color genetic variation and molecular breeding.

    Key words:Cowpea; Flower color; BSA-seq; Genome-wide association analysis; Molecular marker
    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

复制
分享

微信扫一扫:分享

微信里点“发现”,扫一下

二维码便可将本文分享至朋友圈。

文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2024-12-10
  • 最后修改日期:2025-01-19
  • 录用日期:2025-01-21
  • 在线发布日期:
  • 出版日期:
文章二维码
您是第位访问者
ICP:京ICP备09069690号-23
京ICP备09069690号-23
植物遗传资源学报 ® 2025 版权所有
技术支持:北京勤云科技发展有限公司
请使用 Firefox、Chrome、IE10、IE11、360极速模式、搜狗极速模式、QQ极速模式等浏览器,其他浏览器不建议使用!