摘要
对谷子四大名米(沁州黄、桃花米、龙山小米及金米)原始地方品种及其同名品种共计179份开展为期两年的农艺性状调查并对其进行基于SNP标记的亲缘关系分析,从中选择51份进行营养品质测定。结果表明:从农艺性状来看,四类名米品种在数量性状上具有明显差异,而质量性状在不同类品种间差异不大。相关性分析表明,穗重与穗粒重、草重与穗重呈极显著正相关。主成分分析表明前3个主成分解释了累积变异的89.414%,基于主成分分析结果计算了综合得分F值,菠菜根-30的综合得分最高(F=7.42),阴天旱-27的综合得分最低(F=-9.17)。亲缘关系结果表明,各同名品种间存在多样的进化关系,不同名品种间可能存在基因交流。基于农艺性状对179份材料进行聚类分析,发现材料划归4个类群,同名品种内聚集相对集中,农艺性状相似度较大。从营养品质上看,四类名米间营养品质差异较小,除粗纤维外其余营养品质指标差异均不显著。相关性分析发现粗蛋白与粗脂肪呈现显著的正相关;淀粉与蛋白质、脂肪之间呈现显著的负相关。主成分分析表明前6个主要成分解释了累积变异的88.414%,能够基本涵盖10个营养品质的信息,基于主成分分析,结合不同品种谷子的综合得分,对小米品质进行排名,排名靠前的品种有菠菜根-77、菠菜根-33、菠菜根-44、爬坡糙-15、九根齐-25和阴天旱-13。本研究对四大名米品种群的农艺性状、品质性状和亲缘关系的鉴定和研究,对种质资源保护和利用,以及优异资源的挖掘具有重要意义。
谷子(Setaria italica (L.) Beauv.)是起源于我国黄河流域且具有代表性的杂粮作物,因其耐旱、水分利用率高、耐瘠薄,在种植业结构调整、绿色农业发展中起到重要作用,同时也是应对气候变化的战略储备作物之
谷子富含淀粉、蛋白质、人体必需氨基酸、多种矿物元素和维生
种质资源的近缘关系研究对确定不同谷子品种的遗传背景,促进资源的高效利用以及育种亲本的选择等具有重要意义。分子标记法是开展种质间亲缘关系研究的有效且常用手段之
我国历史上谷子有四大传统名米,即山西沁县的沁州黄、河北蔚县的桃花米、山东章丘的龙山小米、山东金乡的金米。上述名米品种商品性和适口性俱佳、营养丰富、品质优异,都曾被选做皇家贡米,同时也深受民间百姓喜爱。随着市场经济的发展,各地都在挖掘传统名米资源,打造现代名米品牌,提升小米经济效益。例如山西的沁州黄目前已成为小米高端品牌,经济效益显
为了系统研究谷子四大传统名米(沁州黄、桃花米、龙山小米、金米)的原始品种及其同名品种在农艺性状上是否存在显著差异,哪类名米类群具有更好的生产潜力,以及不同品种之间的亲缘关系如何,本研究对179份谷子材料在河北张家口进行了为期两年的农艺性状调查,并基于SNP标记探究不同材料之间的亲缘关系,同时在遗传多样性分
本研究进行农艺性状调查和亲缘关系分析的179份谷子材料均来源于国家作物种质库(https://doi.org/10.13430/j.cnki.jpgr.20230609004,
性状 Traits | 赋值标准 Assignment standard | ||||
---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | |
鞘色 LSC | 绿色 | 黄绿色 | 淡紫色 | 中紫色 | 紫色 |
苗色 PC | 绿色 | 黄绿色 | 淡紫色 | 中紫色 | 紫色 |
刺毛颜色 CC | 绿色 | 黄绿色 | 淡紫色 | 中紫色 | 紫色 |
穗颈姿态 NS | 直立 | 中弯 | 弯曲 | 勾形 | - |
穗码密度 SD | 稀疏 | 中 | 紧密 | - | - |
穗形 ES | 鸡嘴形 | 纺锤形 | 圆筒形 | 棍棒形 | 佛手形 |
-:无赋值
-:No assignment;LSC:Leaf sheath color;PC:Plant color;CC:Chaeta color;NS:Ear neck posture;SD:Spike density;SS:Ear shape;The same as below
试验材料于2021-2022年种植于河北省张家口市试验基地(40.6°N, 115.1°E),每个品种种植5行,行长2 m,行距50 cm。
在不同生育阶段调查表型性状。幼苗期记录材料的鞘色和叶色,灌浆期记录刺毛颜色,成熟期记录穗颈形状、穗码密度及穗形,对6个质量性状进行赋值用于统计分析(
成熟籽粒脱粒后测定水分,籽粒脱皮磨粉后测定总淀粉、粗蛋白、粗脂肪、灰分、粗纤维含量、胶稠度、抗性淀粉含量、直链淀粉含量和淀粉的消化特性9项营养品质指标。水分测量方法参考《GB 5009.3-2016食品安全国家标准 食品中水分的测定
对179份谷子材料的数量性状统计分析(
性状 Traits | 名称 Name | 2021年 Year 2021 | 2022年 Year 2022 | ||
---|---|---|---|---|---|
平均值±标准差 Mean±SD | 变异系数(%) CV | 平均值±标准差 Mean±SD | 变异系数(%) CV | ||
株高(cm) PH | 爬坡糙 | 194.95±10.75 | 5.51 | 190.45±11.88 | 6.24 |
九根齐 | 162.66±13.85 | 8.51 | 164.08±13.32 | 8.12 | |
阴天旱 | 196.55±28.41 | 14.46 | 195.73±28.88 | 14.76 | |
菠菜根 | 165.14±11.30 | 6.84 | 165.11±11.69 | 7.08 | |
穗长(cm) EL | 爬坡糙 | 34.91±3.89 | 11.14 | 34.73±3.77 | 10.84 |
九根齐 | 33.01±5.38 | 16.30 | 33.08±5.51 | 16.64 | |
阴天旱 | 22.99±3.35 | 14.58 | 22.87±3.40 | 14.87 | |
菠菜根 | 25.31±5.01 | 19.80 | 25.15±4.83 | 19.21 | |
穗粗(cm) ED | 爬坡糙 | 3.51±0.39 | 11.23 | 3.37±0.46 | 13.57 |
九根齐 | 3.18±1.12 | 35.18 | 3.16±1.21 | 38.43 | |
阴天旱 | 2.83±0.58 | 20.52 | 2.85±0.63 | 22.16 | |
菠菜根 | 2.53±0.65 | 25.70 | 2.51±0.62 | 24.60 | |
穗粒重(g) KW | 爬坡糙 | 30.38±8.97 | 29.52 | 29.78±8.74 | 29.36 |
九根齐 | 23.00±10.11 | 43.96 | 23.00±10.13 | 44.02 | |
阴天旱 | 17.79±4.92 | 27.65 | 17.56±4.97 | 28.32 | |
菠菜根 | 16.48±6.29 | 38.15 | 16.26±6.35 | 39.06 | |
穗重(g) EW | 爬坡糙 | 53.60 ±12.87 | 24.00 | 55.42±10.98 | 19.81 |
九根齐 | 36.51±15.17 | 41.54 | 40.94±12.13 | 29.63 | |
阴天旱 | 27.38±6.80 | 24.85 | 33.79±5.69 | 16.82 | |
菠菜根 | 24.70±8.71 | 35.28 | 31.58±7.23 | 22.89 | |
草重(g) SW | 爬坡糙 | 137.87±22.18 | 16.09 | 136.26±22.96 | 16.85 |
九根齐 | 83.98±32.21 | 38.35 | 82.37±32.85 | 39.88 | |
阴天旱 | 71.60±21.35 | 29.81 | 69.99±21.62 | 30.88 | |
菠菜根 | 58.21±21.00 | 36.07 | 56.08±20.58 | 36.70 |
PH:Plant height;EL:Ear length;ED:Ear diameter;KW:Kernel weight of single ear;EW:Ear weight;SW:Stalk weight;The same as below

图1 参试材料的数量性状统计
Fig. 1 Quantitative trait statistics of the participating materials
其中,通过分子标记进行亲缘关系分析筛选的用于品质分析的51份材料中,株高介于141.12~234.64 cm,变异系数为12.37%;穗长介于17.56~39.88 cm,变异系数为19.07%;穗粗介于1.60~4.96 cm,变异系数为25.42%;穗粒重介于15.00~74.00 g,变异系数为41.54%;穗重介于8.40~47.40 g,变异系数为39.44%;草重介于4.20~168.00 g,变异系数为44.62%。
对苗色、鞘色、刺毛颜色、穗颈姿态、穗形和穗码密度6项质量性状统计结果显示,179份材料的苗色、鞘色和刺毛颜色绿色最多,分别有110、66和124份。穗颈姿态勾形资源最多,有165份,其余为弯曲;穗形中鸡嘴形和圆筒形最多,分别有103份和57份;穗码密度中等和稀疏的材料较多,分别为83和71份。对于四类同名品种而言,爬坡糙、九根齐和阴天旱的苗色、鞘色和刺毛颜色为绿色的材料占比均在43.9%以上;菠菜根苗色和刺毛颜色绿色占比50.5%和75.8%,鞘色淡紫色占比53.8%。四种同名品种的穗颈姿态勾形最多;穗形鸡嘴形最多,其次为圆筒形;同时,爬坡糙与九根齐的穗码密度比较稀疏,阴天旱与菠菜根穗码密度则以中等为主(


图2 同名品种质量性状统计
Fig.2 Statistics of quality characters of homonyms accessions
分级标准参考表1
Grading criteria reference table 1;PPC: Papocao; JGQ: Jiugenqi; YTH: Yintianhan; BCG: Bocaigen
为探究不同性状之间的相关性,对参试材料的12个农艺性状进行相关性分析,结果表明草重与穗重、穗重与穗粒重相关系数较大,分别为0.841和0.899,苗色与鞘色、穗粗与草重、穗长与草重、穗粗与穗粒重均呈极显著正相关;穗码密度与草重、穗长、穗粗、穗粒重均呈极显著负相关。在12个表型性状中,穗形与其他大多数性状相关系数均较小,穗码密度与其他大多数性状呈负相关关系(

图3 参试品种的农艺性状相关性分析
Fig. 3 Correlative coefficient of tested accessions
*在0.05 水平上显著相关;**在0 .01 水平上显著相关;***在0.001 水平上显著相关;红色正相关,蓝色负相关,颜色越深代表相关系数越大;下同
*Significantly correlated at the 0.05 level; **Significantly correlated at the 0.01 level; ***Significantly correlated at the 0.001 level; Red is positively correlated, blue is negatively correlated, with darker colors representing larger correlation coefficients;The same as below
为更加准确、标准地对谷子种质资源进行评价,对参试材料的7个数量性状进行主成分分析(
性状 Traits | 主成分 Principal component | ||
---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | |
穗重EW | 0.954 | 0.063 | -0.016 |
穗粒重KW | 0.909 | -0.045 | -0.204 |
草重SW | 0.873 | 0.302 | 0.1 |
穗粗ED | 0.768 | -0.195 | -0.436 |
穗长EL | 0.686 | -0.208 | 0.654 |
株高PH | 0.009 | 0.978 | 0.013 |
特征值 Eigenvalue | 3.561 | 1.135 | 0.669 |
贡献率(%)Contribution rate | 59.348 | 18.919 | 11.147 |
累计贡献率(%)Cumulative contribution rate | 59.348 | 78.267 | 89.414 |
聚类分析可以探究不同谷子品种之间的亲缘关系,进而将不同品种进行分类。为探寻不同谷子种质资源间的亲缘性,基于农艺性状数据,利用R(4.1.2)软件包对179份材料进行聚类分析(

图4 基于农艺性状的谷子品种聚类分析
Fig. 4 Cluster analysis of 179 foxtail millet accessions based on agronomic traits
材料序号同附表1
Material serial number as in supplementary table 1
本研究测定了51份谷子材料的水分、营养品质、胶稠度和消化特性共10个指标(

图5 谷子营养品质测定结果
Fig. 5 Nutrient quality test of foxtail millet
WAC:Water content;SC:Starch content;PC:Protein content;FAC:Fat content;AC:Ash content;FC:Fiber content;GCC:Gel consistency content;AMC:Amylose content;RSC:Resistance starch content;RDSC:Readily digestible starch content;SDSC:Slowly digestible starch content;The same as below
四大名米同名品种间水分、总淀粉和灰分含量相近,粗蛋白、粗脂肪、粗纤维存在差异,其中九根齐同名品种的粗蛋白含量最高,爬坡糙同名品种的粗脂肪含量最高,阴天旱同名品种的粗纤维含量最高。总淀粉含量变异系数最小的是阴天旱群体(1.9652%),最大的是爬坡糙群体(3.4535%);粗蛋白含量变异系数最小的是九根齐群体(6.1027%),最大的是爬坡糙群体(9.4584%);粗脂肪含量变异系数最小的是菠菜根群体(10.3554%),最大的是九根齐群体(14.9168%);粗纤维含量变异系数最小的是九根齐群体(8.0012%),最大的是阴天旱群体(16.8318%)。在胶稠度方面,菠菜根群体的胶稠度略高于其他群体;九根齐群体的直链淀粉和慢速消化淀粉平均含量略高于其他群体;菠菜根抗性淀粉和快速消化淀粉平均含量略高于其他群体;抗性淀粉和直链淀粉含量变异系数最大的是九根齐群体(68.9591%和23.5923%),快速、慢速消化淀粉含量变异系数最大的分别是爬坡糙群体(39.3072%)和菠菜根群体(79.9064%)。方差分析显示水分、淀粉、粗蛋白、粗脂肪、灰分、直链淀粉、抗性淀粉含量、胶稠度和消化特性在四大名米群体间差异不显著,粗纤维含量有显著性差异(P<0.05)(
性状 Traits | 参数 Parameter | 爬坡糙 PPC | 九根齐 JGQ | 阴天旱 YTH | 菠菜根 BCG |
---|---|---|---|---|---|
水分含量(%) WAC | 平均值±标准差 | 8.8975±0.2187a | 8.948±0.289a | 8.8943±0.2623a | 8.7453±0.3254a |
变异系数 (%) | 2.4580 | 3.2298 | 2.9491 | 3.7209 | |
总淀粉含量(%) SC | 平均值±标准差 | 73.2474±2.5296a | 73.0918±1.8176a | 74.6781±1.4676a | 73.9564±2.1412a |
变异系数 (%) | 3.4535 | 2.4867 | 1.9652 | 2.8952 | |
粗蛋白含量 (%)PC | 平均值±标准差 | 11.6975±1.1064a | 12.224±0.746a | 11.2643±0.8411a | 11.8089±0.966a |
变异系数 (%) | 9.4584 | 6.1027 | 7.467 | 8.1803 | |
粗脂肪含量(%) FAC | 平均值±标准差 | 4.1275±0.5536a | 4.088±0.6098a | 3.7729±0.4283a | 3.9168±0.4056a |
变异系数 (%) | 13.4125 | 14.9168 | 11.352 | 10.3554 | |
灰分含量(%) AC | 平均值±标准差 | 2.6163±0.1851a | 2.716±0.1601a | 2.6436±0.166a | 2.7184±0.2278a |
变异系数 (%) | 7.0749 | 5.8947 | 6.2793 | 8.3799 | |
粗纤维含量(%) FC | 平均值±标准差 | 7.0306±1.1061b | 8.035±0.6429ab | 9.0014±1.5151a | 8.4882±1.0393ab |
变异系数 (%) | 15.7327 | 8.0012 | 16.8318 | 12.2441 | |
胶稠度(%) GCC | 平均值±标准差 | 54.2500±13.1601a | 57.4000±34.9548a | 63.2143±13.6391a | 67.6316±11.0034a |
变异系数 (%) | 24.2582 | 60.8969 | 21.576 | 16.2696 | |
抗性淀粉含量(%) RSC | 平均值±标准差 | 3.8400±1.5327a | 2.9100±2.0084a | 4.1300±2.4135a | 4.8700±2.2882a |
变异系数 (%) | 39.9316 | 68.9591 | 58.3939 | 47.0260 | |
直链淀粉含量(%) AMC | 平均值±标准差 | 17.4600±2.7136a | 20.4200±4.8167a | 18.6900±3.3055a | 20.1100±3.1237a |
变异系数 (%) | 15.5376 | 23.5923 | 17.6852 | 15.5310 | |
快速消化淀粉含量(%) RDSC | 平均值±标准差 | 60.8600±23.9225a | 60.3200±22.2359a | 72.1200±10.6289a | 72.2500±14.3252a |
变异系数 (%) | 39.3072 | 36.8662 | 14.7368 | 19.8269 | |
慢速消化淀粉含量(%) SDSC | 平均值±标准差 | 21.2300±10.1137a | 23.7300±17.8876a | 18.6400±5.7149a | 17.4400±13.9395a |
变异系数 (%) | 47.6583 | 75.3942 | 30.6524 | 79.9064 |
同行不同小写字母表示差异在0.05水平显著
Different lowercase letters in the same row indicate that the difference is significant at the 0.05 level
对四大名米原始品种进一步分析,结果显示沁州黄的原始品种爬坡糙-11的淀粉、粗纤维、直链淀粉和快速消化淀粉含量低于爬坡糙同名品种的平均值,其余指标均高于爬坡糙同名品种的平均值;桃花米原始品种九根齐-7的粗纤维、直链淀粉和慢速消化淀粉含量低于九根齐同名品种的平均值,其余指标均高于九根齐同名品种的平均值;龙山小米原始品种阴天旱-30的淀粉、粗蛋白、粗脂肪、粗纤维、直链淀粉、抗性淀粉含量低于同名品种的平均值,灰分含量、胶稠度、快速消化淀粉和慢速消化淀粉含量高于平均值;金米原始品种菠菜根-44的淀粉、灰分、快速和慢速消化淀粉低于九根齐同名品种的平均值,其余指标均高于九根齐同名品种的平均值。
为探究不同营养品质之间的关联程度,对51份试验材料的营养品质进行相关性分析(

图6 营养品质的相关性分析
Fig. 6 Correlation analysis of nutritional qualities
为综合性评价不同谷子种质资源的营养品质,对测定的10个营养指标进行主成分分析(
性状 Traits | 主成分 Principal component | |||||
---|---|---|---|---|---|---|
1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 | |
慢速消化淀粉含量SDSC | -0.366 | 0.723 | 0.049 | -0.023 | -0.253 | 0.137 |
快速消化淀粉含量RDSC | -0.335 | 0.790 | 0.206 | 0.063 | -0.136 | 0.119 |
抗性淀粉含量RSC | -0.616 | -0.294 | 0.092 | -0.138 | -0.068 | 0.073 |
直链淀粉含量AMC | 0.052 | 0.650 | -0.086 | 0.404 | 0.218 | -0.156 |
胶稠度含量GCC | -0.145 | 0.216 | -0.539 | -0.392 | 0.523 | 0.403 |
粗纤维含量FC | 0.382 | -0.229 | 0.255 | 0.382 | -0.163 | 0.732 |
灰分含量AC | 0.876 | 0.052 | -0.054 | -0.204 | -0.090 | 0.036 |
粗脂肪含量FAC | 0.420 | -0.034 | -0.114 | 0.518 | 0.478 | 0.004 |
粗蛋白含量PC | 0.830 | 0.218 | 0.251 | -0.220 | 0.079 | -0.058 |
总淀粉含量SC | 0.913 | 0.114 | 0.058 | -0.204 | -0.067 | -0.032 |
特征值 Eigenvalue | 2.691 | 1.789 | 1.509 | 1.103 | 1.061 | 0.689 |
贡献率(%)Contribution rate | 26.906 | 17.889 | 15.088 | 11.028 | 10.605 | 6.890 |
累计贡献率(%) Cumulative contribution rate | 26.906 | 44.796 | 59.883 | 70.911 | 81.517 | 88.407 |
基于主成分分析,结合不同品种的综合得分对参试材料进行排名(
品种 Accessions | F1 | F2 | F3 | F4 | F5 | F6 | F综合值 F synthesis value | 排名 Ranking |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
菠菜根-77 Bocaigen-77 | 1.28 | 2.43 | 1.58 | 2.12 | -0.68 | 0.20 | 1.19 | 1 |
菠菜根-33 Bocaigen-33 | 2.84 | 2.07 | 0.25 | -1.34 | 0.75 | 0.39 | 1.13 | 2 |
菠菜根-44 Bocaigen-44 | 2.03 | 1.38 | 0.53 | 2.12 | 0.35 | -1.27 | 1.06 | 3 |
爬坡糙-15 Papocao-15 | 3.25 | 1.01 | -1.01 | -0.88 | 1.36 | -1.20 | 0.87 | 4 |
九根齐-25 Jiugenqi-25 | 2.61 | -3.33 | 5.57 | -2.05 | -0.24 | -0.21 | 0.68 | 5 |
阴天旱-13 Yintianhan-13 | 2.04 | 0.75 | 1.08 | -0.82 | -0.96 | 0.27 | 0.67 | 6 |
九根齐-21 Jiugenqi-21 | 2.39 | 1.99 | 0.06 | -2.35 | -0.65 | -0.21 | 0.66 | 7 |
九根齐-23 Jiugenqi-23 | 4.05 | -1.86 | -2.26 | 1.62 | 0.15 | 0.69 | 0.66 | 8 |
菠菜根-72 Bocaigen-72 | -0.01 | 1.23 | 1.07 | 0.50 | 1.20 | 1.39 | 0.66 | 9 |
阴天旱-38 Yintianhan-38 | 0.95 | 0.90 | 0.48 | 0.65 | -0.10 | 1.50 | 0.65 | 10 |
菠菜根-50 Bocaigen-50 | 0.40 | 1.39 | 1.53 | 0.31 | -0.02 | -0.01 | 0.62 | 11 |
爬坡糙-10 Papocao-10 | 1.66 | 0.88 | 0.40 | -0.01 | -0.45 | -0.05 | 0.61 | 12 |
菠菜根-23 Bocaigen-23 | 0.48 | 1.73 | 0.19 | 0.15 | 0.67 | 0.42 | 0.58 | 13 |
阴天旱-16 Yintianhan-16 | -0.06 | 0.98 | 1.15 | 0.47 | 0.13 | 0.24 | 0.41 | 14 |
爬坡糙-11 Papocao-11 | 2.49 | -1.47 | -0.04 | -0.69 | 0.34 | -0.58 | 0.32 | 15 |
阴天旱-8 Yintianhan-8 | -0.41 | 0.58 | 0.51 | 1.94 | -0.51 | -0.14 | 0.22 | 16 |
菠菜根-53 Bocaigen-53 | 0.40 | -0.08 | -0.20 | 0.19 | 0.61 | 0.40 | 0.18 | 17 |
菠菜根-2 Bocaigen-2 | 1.09 | -1.83 | -0.83 | 0.98 | 1.98 | 0.09 | 0.17 | 18 |
菠菜根-95 Bocaigen-95 | 0.02 | 0.10 | 0.48 | 1.57 | 0.70 | -2.49 | 0.17 | 19 |
菠菜根-13 Bocaigen-13 | -1.48 | 0.93 | 0.35 | 1.15 | 1.30 | 0.41 | 0.11 | 20 |
菠菜根-65 Bocaigen-65 | -0.39 | -0.20 | 0.57 | 0.78 | 0.07 | 0.83 | 0.10 | 21 |
九根齐-14 Jiugenqi-14 | 1.74 | 0.25 | -1.98 | 0.31 | -2.04 | -0.75 | -0.02 | 22 |
菠菜根-19 Bocaigen-19 | 0.51 | -1.30 | -0.74 | -0.37 | 0.91 | 1.52 | -0.04 | 23 |
九根齐-26 Jiugenqi-26 | -0.47 | 1.01 | -0.67 | -0.53 | 0.47 | -0.31 | -0.08 | 24 |
九根齐-16 Jiugenqi-16 | -0.15 | 0.72 | -1.25 | 0.35 | -0.48 | 0.14 | -0.10 | 25 |
九根齐-8 Jiugenqi-8 | -0.21 | 0.57 | -0.49 | -0.45 | -0.38 | 0.01 | -0.11 | 26 |
菠菜根-75 Bocaigen-75 | -1.63 | 0.46 | 1.32 | 0.42 | -0.34 | 0.14 | -0.14 | 27 |
菠菜根-42 Bocaigen-42 | 0.55 | -2.77 | 0.04 | 0.47 | 0.65 | 0.97 | -0.15 | 28 |
阴天旱-1 Yintianhan-1 | -0.94 | 1.33 | -0.83 | -1.09 | 0.24 | 0.92 | -0.17 | 29 |
阴天旱-10 Yintianhan-10 | -1.46 | -0.65 | 1.83 | 1.45 | -1.00 | 0.05 | -0.18 | 30 |
菠菜根-78 Bocaigen-78 | -0.63 | 1.77 | -0.06 | -1.11 | -1.70 | -0.57 | -0.20 | 31 |
爬坡糙-12 Papocao-12 | -0.04 | 0.41 | -1.04 | -0.69 | -0.17 | -0.53 | -0.23 | 32 |
九根齐-11 Jiugenqi-11 | -1.23 | 0 | -0.91 | 1.45 | 1.26 | -0.86 | -0.23 | 33 |
九根齐-7 Jiugenqi-7 | -1.32 | 0.72 | -0.48 | -0.40 | 0.88 | 0.21 | -0.24 | 34 |
阴天旱-5 Yintianhan-5 | -0.37 | 0.13 | -0.73 | 0.68 | -1.35 | 0.20 | -0.24 | 35 |
九根齐-10 Jiugenqi-10 | 1.04 | -1.88 | -2.31 | 0.01 | 0.01 | 1.76 | -0.28 | 36 |
阴天旱-21 Yintianhan-21 | -0.63 | -1.07 | 0.25 | 0.19 | -1.45 | 1.26 | -0.37 | 37 |
阴天旱-37 Yintianhan-37 | -2.42 | 0.05 | 0.09 | 0.12 | 2.14 | -0.06 | -0.39 | 38 |
爬坡糙-13 Papocao-13 | 0.65 | -0.82 | -1.35 | -0.73 | -1.01 | -0.86 | -0.42 | 39 |
阴天旱-32 Yintianhan-32 | -1.79 | -0.64 | 0.70 | -0.54 | 1.56 | -0.50 | -0.42 | 40 |
爬坡糙-2 Papocao-2 | 0.65 | -3.17 | -0.05 | 0.78 | -0.67 | -1.54 | -0.49 | 41 |
阴天旱-29 Yintianhan-29 | -1.41 | -0.83 | 0.62 | -0.63 | 0.46 | -0.58 | -0.50 | 42 |
阴天旱-30 Yintianhan-30 | -1.28 | -0.33 | -0.03 | -1.27 | -0.11 | 0.49 | -0.53 | 43 |
爬坡糙-9 Papocao-9 | -1.28 | 0.51 | -1.03 | -2.17 | 0.99 | 0 | -0.54 | 44 |
菠菜根-80 Bocaigen-80 | -1.15 | 0.44 | -0.85 | -1.11 | 0.06 | -1.35 | -0.57 | 45 |
菠菜根-41 Bocaigen-41 | -1.41 | -1.08 | 0.03 | -0.38 | -0.07 | 0.43 | -0.59 | 46 |
阴天旱-4 Yintianhan-4 | -1.06 | -0.85 | -1.19 | -0.96 | -0.35 | -0.15 | -0.77 | 47 |
阴天旱-3 Yintianhan-3 | -1.65 | -0.06 | -0.34 | 0.48 | -3.56 | 0.62 | -0.79 | 48 |
菠菜根-6 Bocaigen-6 | -3.17 | -0.23 | 0.61 | -0.15 | 0.18 | 0.21 | -0.79 | 49 |
菠菜根-84 Bocaigen-84 | -1.40 | -2.22 | -0.62 | -0.17 | -0.74 | -0.97 | -1.03 | 50 |
爬坡糙-3 Papocao-3 | -3.69 | -0.04 | 0.01 | -0.34 | -0.42 | -0.55 | -1.12 | 51 |
对179份名米品种进行重测序,过滤获得了4052768个高质量SNP标记,利用SNP标记对参试材料进行群体结构分析。进化树结果表明(

图7 基于SNP标记的进化树
Fig. 7 Evolutionary tree based on the SNP
红色:爬坡糙;黄色:九根齐;绿色:阴天旱;蓝色:菠菜根; 下同
Red: Papocao; Yellow: Jiugenqi; Green: Yintianhan; Bluet: Bocaigen; The same as below

图8 基于SNP标记的群体结构
Fig. 8 A population structure analysis based on the SNP
纵坐标表示类群构成比例;Ⅰ-Ⅶ表示不同类群
The vertical coordinate indicates the proportion of group composition; Ⅰ-VII indicate different groups
我国谷子种质资源在形态性状方面具有丰富的多样性,地方品种的广泛变异为谷子育种提供了重要的遗传资源,对地方品种进行全面评价和利用是拓展谷子育种遗传基础的重要途
本研究对179份谷子名米品种及其同名地方品种的12项农艺性状进行调查,以期筛选出兼具产量潜力和优异食用品质的种质提供育种利用。结果显示四类名米群体的数量性状有明显差异,爬坡糙群体均表现为中等株高、大穗、大粒以及高产草量,阴天旱群体表现为高秆、穗小且细、籽粒小以及低产草量,九根齐表现为矮秆、长穗、中等穗粗、中等穗重以及中等产草量,菠菜根则表现为矮秆、小细穗、穗重和草重轻。在质量性状方面,爬坡糙与九根齐两类品种性状表现相似,苗色、鞘色和刺毛颜色均为绿色最多、穗颈姿态勾形最多、穗形多为鸡嘴形且穗码密度较稀疏,阴天旱群体的苗色、叶鞘色和刺毛颜色均为绿色最多、穗颈姿态为勾形最多、穗形多为鸡嘴形但穗码密度中等,而菠菜根群体鞘色为淡紫色最多、穗颈姿态勾形最多、穗形多为鸡嘴形且穗码密度中等。这一结果说明同名品种群体间具有相似的表型,为利用优良地方品种开展谷子高产和品质育种提供了良好的数据支撑。
从179个品种个体间统计来看,数量性状基本符合正态分布,在颜色性状方面,占比最大的均是绿色,除此之外在鞘色和刺毛颜色中,淡紫色材料也较多,推测可能是材料中菠菜根同名品种占比较多,菠菜根品种大多因为幼苗时期鞘色呈现淡紫色到深紫色而得名。与贾小平
相关性分析表明数量性状如穗粗与穗粒重性状间极显著相关,而穗形与其他大部分性状相关性不显著,穗形与其他性状相关性小的原因推测为本研究中的材料穗形种类较少,且多为鸡嘴形、圆筒形等相近的穗形。李涛
基于农艺性状的聚类分析将参试179份材料分为4个类群,同名品种聚类相对集中,爬坡糙同名品种大部分聚在类群Ⅱ和类群Ⅳ中,九根齐同名品种大部分聚在类群Ⅳ中;阴天旱同名品种大部分聚在类群Ⅱ和类群Ⅳ中,少量聚在类群Ⅲ中;菠菜根同名品种大部分聚在类群Ⅱ和类群Ⅳ中,类群Ⅱ中的菠菜根同名品种草重轻、穗码紧密,而类群Ⅳ中的菠菜根同名品种草重较大、穗码密度较稀疏。由此可知,聚类结果与品种来源以及主要农艺性状相一致,同名品种的农艺性状相似性较高。
脱壳后谷子称为小米,小米中含有蛋白质、脂肪、淀粉、维生素和矿物质等营养成分,以及丰富的叶酸、 维生素 E、类胡萝卜素及硒等微量元
胶稠度是衡量谷子适口性的重要指标,胶稠度与适口性呈正相关关系,本研究所选材料胶稠度差异很大,变化范围为33~160 mm,其中九根齐-25胶稠度高达160 mm。曲丽洁
相关性分析发现淀粉与蛋白质含量的相关性最高,而脂肪含量、胶稠度、直链淀粉、抗性淀粉和消化特性与其他营养成分之间的相关性较弱。主成分分析结果表明前6个主成分解释了累积变异的88.407%,能够表示参测材料营养品质的大部分信息。通过测定结果,筛选到了一些营养品质综合表现优异的材料,例如菠菜根-77、菠菜根-33、菠菜根-44、爬坡糙-15、九根齐-25和阴天旱-13等,这些资源为谷子品质育种提供优异的可供育种利用材料。
同名品种的存在是种质资源收集过程中的常见现象,而在保存于国家作物种质库中的谷子资源中,存在同名现象的谷子约占总资源的60%。亲缘关系分析是资源鉴定、育种改良和创新的重要手段。在本研究中,基于SNP的亲缘关系分析结果表明,参试材料之间亲缘关系较为多样化,进化树分析可以将四大名米同名品种明显区分,说明各同名品种之间的遗传一致性较高;部分不同名但地理来源相近的品种间存在较近的亲缘关系,说明相近地理来源的品种经过长期种植过程中存在部分的基因交流。群体结构分析将四大名米同名品种划分为7个类群,各同名品种大多数聚在一起,少数不同名品种聚在一起,结果与进化树分析结果相一致。此外,个别材料的亲缘关系与地理来源存在略微差异,这与前人研究结果相一
谷子四大名米品种群间农艺性状具有显著差异,爬坡糙系列品种具有穗粗、穗粒重大等优异性状,可作为谷子高产育种的亲本材料;聚类分析显示同名品种基本聚为一类,其农艺性状相似度较大。四大名米品种群间营养品质差异较小,名米品种的原始品种较其他同名品种相比品质性状更突出。进化树和群体结构结果表明参试材料存在丰富的遗传变异。根据营养品质的综合得分对品质进行排名,筛选出一批在营养成分上表现优良的谷子品种,例如九根齐-25,可为谷子品质育种提供可利用材料。
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