摘要
盐碱地是边际土壤的主要类型之一,利用边际土地耕作是减缓耕地紧缺的有效途径。为筛选耐盐性较强的大豆种质资源,提高盐碱土地大豆产量,本研究对392份来自国内外不同地域的大豆种质资源,采用150 mmol/
高产、优质、稳产、适应性强、现代化和机械化是21世纪农作物的基本要
简单重复序列标记(SSR,simple sequence repeats)又称微卫星序列标记(MS,microsatellite sequence),是一种以特异引物PCR为基础的分子标记技术,具有多态性高、重复性好、稳定性好、可靠性高、简便快捷、实验成本较低等优点。田
虽有学者对大豆种质资源在苗
372份国内大豆种质资源和20份国外大豆种质资源,共392份材料,由东北农业大学收集并保存。材料分布情况如下:黑龙江省257份,吉林省42份,辽宁省16份,内蒙古22份,北京18份,河北省7份,山东省4份,湖北省2份,天津、新疆、浙江省以及甘肃省各1份,国外20份。
参考刘谢香
耐盐级别 Salt tolerance grade | 表型特征 Phenotypic characterization |
---|---|
1 | 健康的绿叶,没有观察到损伤 |
2 | 轻度坏死,真叶轻微发黄 |
3 | 中度坏死,三出复叶发黄 |
4 | 严重坏死,超过75%叶面发黄 |
5 | 凋亡,植物完全枯萎 |
盐害指数(%) Salinity index | 耐盐等级 Salt tolerance class |
---|---|
0.0~20.0 | 高耐 |
20.1~40.0 | 耐盐 |
40.1~60.0 | 中耐 |
60.1~80.0 | 敏感 |
80.1~100.0 | 高敏 |
盐害指数计算公式:
将鉴定出的高耐和耐盐大豆种质资源叶片从-80 ℃冰箱取出,按照CTAB
采用张海燕
标记名称 Marker name | 正向序列(5'-3') Forward sequence (5'-3') | 反向序列(5'-3') Reverse sequence(5'-3') |
---|---|---|
Sat_091 | CTTCTGGATAGTTGGGACTGATA | GGAACAGGTCGTGAAAAGTTAT |
Satt339 | TAATATGCTTTAAGTGGTGTGGTTATG | GTTAAGCAGTTCCTCTCATCACG |
Sat_162 | GCGTGGTTTTTCGCTGGATATA | GCGCATTTCGTAACATATTTTTCAC |
Satt239 | GCGCCAAAAAATGAATCACAAT | GCGAACACAATCAACATCCTTGAAC |
Satt462 | CGGTCACGAATACAAGATAAATAATGC | GCGTGCATGTCAGAAAAAATCTCTATAA |
Satt281 | AAGCTCCACATGCAGTTCAAAAC | TGCATGGCACGAGAAAGAAGTA |
Satt237 | GCGTGATTTCAATCCTTTTTC | GCGGTTGTCCTGTTAGAACCT |
Satt636 | GTCATGACTCATGAGTCACGTAAT | GCTGCATATCCACTCTCATTGACT |
Satt588 | GAGCCAAAACCAAAGTGAAGAAC | CCAACTAATCCCAGGGACTTACTT |
Satt201 | GCGTTGATACTTTCCTAAGACAAT | GGGAGAGAAGGCAATCTAA |
标记名称 Marker name | 染色体 Chromosome | 正向序列(5'-3') Forward sequence (5'-3') | 反向序列(5'-3') Reverse sequence(5'-3') |
---|---|---|---|
Satt184 | 1 | GCGCTATGTAGATTATCCAAATTACGC | GCCACTTACTGTTACTCAT |
Satt141 | 2 | CGGTGGTGGTGTGCATAATAA | CCGTCATAAAAAGTCCCTCAGAAT |
Sat_379 | 3 | GCGTTTTGGCTCATCTTTCTTTTA | GCGGCCCTAAGCACAACTGAACCTAT |
Satt396 | 4 | GCGAAAAGGGATAAGTTTAAAAAT | GCGGGCCTGTAAAGGGATTCC |
Satt211 | 5 | GAAAAAGCCCACATCCAA | CATGGGCATGCAGTAACA |
Satt643 | 6 | CGGGATAAATAGAAGTGGAACA | TTGGCAAATGTGAAATGTATA |
Satt551 | 7 | GAATATCACGCGAGAATTTTAC | TATATGCGAACCCTCTTACAAT |
AW132402 | 8 | GCGCCTCCCTCCTCTCCTTTCTT | GCGTTTCCCACATATTCTATCATTTGTT |
Satt242 | 9 | GCGTTGATCAGGTCGATTTTTATTTGT | GCGAGTGCCAACTAACTACTTTTATGA |
Satt262 | 10 | GCGCCCCATTAATGTTAACACA | GCGGAGTTCAACGCATTCACCTT |
Satt453 | 11 | GCGGAAAAAAAACAATAAACAACA | TAGTGGGGAAGGGAAGTTACC |
Satt279 | 12 | GCGCAAAAGGACGCCCACCAATAG | GCGGTGATCGGATGTTATAGTTTCAG |
Satt072 | 13 | GGAAAGAATCAGCAAAAT | CCCCCACATAAATAATAAA |
Satt168 | 14 | CGCTTGCCCAAAAATTAATAGTA | CCATTCTCCAACCTCAATCTTATAT |
Satt685 | 15 | ATCGTGGCATGTCTCACTAC | GAGGCGGAAGGAAATCTAAT |
Satt674 | 16 | GCGAATCCTCTAGCTTACCAAAGAA | GCGATTAGCCATCAAAACCTAT |
Satt301 | 17 | GCGAAACACTCCTAGTTGATTACAAA | GCGATATAATGCACAAAGAAATTAAAGA |
Satt309 | 18 | GCGCCTTCAAATTGGCGTCTT | GCGCCTTAAATAAAACCCGAAACT |
Satt373 | 19 | TCCGCGAGATAAATTCGTAAAAT | GGCCAGATACCCAAGTTGTACTTGT |
Satt571 | 20 | GGGTAGGGGTGGAATATAAG | GCGGGATCCGCGGATGGTCAAAG |
采用20 μL PCR反应体系:Buffer(北京酷来搏科技有限公司)2 μL ,Taq酶和dNTP(北京酷来搏科技有限公司)各0.3 μL,上下游引物各1 μL,双蒸水13.4 μL,模板DNA 2 μL。反应程序:95 ℃预变性5 min,94 ℃变性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共循环38次,72 ℃延伸10 min,4 ℃冰箱保存。PCR产物采用6% 聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE,polyacrylamide gel electrophoresis)法检测,电压1500~1800 V,时长2 h。银染法染色,显影后拍照记录。
对电泳图片进行条带读取,将每个等位变异作为一个位点,在该位点相同位置,有条带记为“1”,无条带记为“0”,录入Excel得到矩阵。运用Excel软件进行数据统计分析,计算与耐盐基因连锁的SSR引物的鉴定效率和准确
计算公式如下:
其中耐盐位点数为58份高耐和耐盐等级大豆种质资源与耐盐对照(铁丰8号)对应的等位变异数;为58份高耐和耐盐等级大豆种质资源与盐敏感对照(Williams82)对应的等位变异数。
其中Pij为标记 i 的第 j 个等位变异出现的频率。
392份大豆种质资源盐胁迫处理后的耐盐表型鉴定结果(

图1 盐胁迫处理下高耐、耐盐与高敏大豆种质资源比较
Fig. 1 Comparison of high tolerant, salt-tolerant and high sensitive soybean germplasm resources under salt stress treatment
A: 高耐大豆种质资源中黄50;B: 耐盐大豆种质资源合丰50;C: 高敏大豆种质资源黑农66;左侧为处理组,右侧为对照组
A: High tolerant soybean germplasm resource Zhonghuang 50; B: Salt-tolerant soybean germplasm resource Hefeng50; C: High sensitive soybean germplasm resource Heinong 66; The left side is the treatment and the right side is the control

图2 392份大豆种质资源耐盐等级数量分布
Fig.2 Distribution of salt tolerance class of soybean germplasm resources
序号 No. | 名称 Name | 来源地 Origin | 耐盐等级 Salt tolerance class | 序号 No. | 名称 Name | 来源地 Origin | 耐盐等级 Salt tolerance class |
---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | Williams82(对照) | 国外 | 高敏 | 31 | 中品03-5334 | 北京 | 耐盐 |
2 | 铁丰8号(对照) | 辽宁 | 高耐 | 32 | 中黄10号 | 北京 | 耐盐 |
3 | 黑农51 | 黑龙江 | 耐盐 | 33 | 小白脐 | 辽宁 | 耐盐 |
4 | 克北1号 | 黑龙江 | 耐盐 | 34 | 中作00-683 | 北京 | 耐盐 |
5 | 绥农1号 | 黑龙江 | 耐盐 | 35 | 赫尔松2号 | 国外 | 高耐 |
6 | 合丰29 | 黑龙江 | 耐盐 | 36 | 四粒黄 | 吉林 | 耐盐 |
7 | 中品03-5179 | 北京 | 耐盐 | 37 | 抗线3号 | 黑龙江 | 耐盐 |
8 | 铁丰31 | 黑龙江 | 耐盐 | 38 | 九农21 | 吉林 | 耐盐 |
9 | 中黄908 | 北京 | 耐盐 | 39 | 东农46 | 黑龙江 | 耐盐 |
10 | 呼交11-359 | 内蒙古 | 耐盐 | 40 | 嫩丰15 | 黑龙江 | 耐盐 |
11 | 黑河35 | 黑龙江 | 耐盐 | 41 | 垦丰14 | 黑龙江 | 高耐 |
12 | 黑农71 | 黑龙江 | 耐盐 | 42 | 昌吉黄豆 | 新疆 | 耐盐 |
13 | 黑农48 | 黑龙江 | 耐盐 | 43 | 白城秣食豆 | 吉林 | 耐盐 |
14 | 合丰50 | 黑龙江 | 耐盐 | 44 | 大粒黑豆 | 山东 | 耐盐 |
15 | 长农38 | 吉林 | 耐盐 | 45 | 黑河48 | 黑龙江 | 耐盐 |
16 | 长农33 | 吉林 | 高耐 | 46 | 中作GHJ14403 | 北京 | 耐盐 |
17 | 吉育252 | 吉林 | 高耐 | 47 | 中黄901 | 内蒙古 | 耐盐 |
18 | 赤豆1号 | 内蒙古 | 高耐 | 48 | 宝丰8号 | 黑龙江 | 耐盐 |
19 | 吉育303 | 吉林 | 高耐 | 49 | 蒙豆12 | 内蒙古 | 耐盐 |
20 | 农大38 | 黑龙江 | 耐盐 | 50 | 呼交11-322 | 内蒙古 | 耐盐 |
21 | 农大23 | 黑龙江 | 耐盐 | 51 | 呼交10-206 | 内蒙古 | 耐盐 |
22 | 龙豆5号 | 黑龙江 | 高耐 | 52 | 登科1号 | 内蒙古 | 耐盐 |
23 | 中黄75 | 北京 | 高耐 | 53 | 黑河54 | 黑龙江 | 耐盐 |
24 | 中黄50 | 北京 | 高耐 | 54 | 黑河51 | 黑龙江 | 高耐 |
25 | 中黄48 | 天津 | 高耐 | 55 | 抗线5号 | 黑龙江 | 耐盐 |
26 | 中黄44 | 北京 | 耐盐 | 56 | 丰收12 | 黑龙江 | 耐盐 |
27 | 东农69 | 黑龙江 | 高耐 | 57 | 吉林小粒4号 | 吉林 | 耐盐 |
28 | 东大2号 | 黑龙江 | 耐盐 | 58 | 垦农18 | 黑龙江 | 耐盐 |
29 | L-9 | 国外 | 耐盐 | 59 | 吉育71 | 吉林 | 高耐 |
30 | 五星4号 | 河北 | 高耐 | 60 | 黑农61 | 黑龙江 | 耐盐 |
10个与耐盐基因连锁的SSR标记共检测到42个等位变异(
等位变异 Alleles | 种质数 Germplasm number | 鉴定效率(%) Identification of efficiency | 准确率(%) Iccuracy rating | 等位变异 Alleles | 种质数 Germplasm number | 鉴定效率(%) Identification of efficiency | 准确率(%) Iccuracy rating |
---|---|---|---|---|---|---|---|
Sat_091-1 | 19 | 32.76 | 46.55 | Satt281-1 | 27 | 46.55 | 65.52 |
Sat_091-2 | 8 | Satt281-2 | 11 | ||||
Sat_091-3 | 15 | Satt281-3 | 5 | ||||
Sat_091-4 | 16 | Satt281-4 | 3 | ||||
Satt339-1 | 23 | 39.66 | 67.24 | Satt281-5 | 13 | ||
Satt339-2 | 16 | Satt237-1 | 17 | 29.31 | 60.34 | ||
Satt339-3 | 19 | Satt237-2 | 18 | ||||
Satt339-4 | 10 | Satt237-3 | 8 | ||||
Sat_162-1 | 10 | 17.24 | 79.31 | Satt237-4 | 15 | ||
Sat_162-2 | 36 | Satt636-1 | 10 | 17.24 | 48.28 | ||
Sat_162-3 | 12 | Satt636-2 | 18 | ||||
Satt239-1 | 26 | 44.83 | 72.41 | Satt636-3 | 7 | ||
Satt239-2 | 16 | Satt636-4 | 23 | ||||
Satt239-3 | 7 | Satt588-1 | 28 | 48.28 | 72.41 | ||
Satt239-4 | 9 | Satt588-2 | 14 | ||||
Satt462-1 | 35 | 32.76 | 72.41 | Satt588-3 | 11 | ||
Satt462-2 | 10 | Satt588-4 | 4 | ||||
Satt462-3 | 2 | Satt588-5 | 1 | ||||
Satt462-4 | 4 | Satt201-1 | 35 | 60.34 | 96.55 | ||
Satt462-5 | 5 | Satt201-2 | 21 | ||||
Satt462-6 | 2 | Satt201-3 | 2 |
-1为耐盐等位变异;-2为盐敏感等位变异;-3~-6为其他等位变异
-1 is a salt-tolerant allele; -2 is a salt-sensitive allele; -3 to -6 are the other allelic variants

图3 Satt462在58份耐盐大豆种质资源中的多态分布
Fig. 3 Polymorphic distribution of Satt462 in 58 soybean salt-tolerant germplasm resources
1:Williams82;2:铁丰8号;3~60:58份高耐和耐盐大豆种质资源,编号与表5同;下同
1: Williams82; 2: Tiefeng 8; 3-60: 58 high tolerant and salt-tolerant soybean germplasm resources,number is the same as table 5; The same as below

图4 Satt201在58份耐盐大豆种质资源中的多态分布
Fig. 4 Polymorphic distribution of Satt201 in 58 salt-tolerant soybean germplasm resources
20个标记在58份大豆苗期耐盐种质资源中共获得83个等位变异,不同SSR标记的等位变异数不同,等位变异数范围在2~6之间,平均每个SSR标记有4.15个等位变异(
引物名称 Marker name | 等位基因变异数 Allelic variation | 多态性信息含量 Polymorphism information content | 引物名称 Marker name | 等位基因变异数 Allelic variation | 多态性信息含量 Polymorphism information content |
---|---|---|---|---|---|
Satt211 | 2 | 0.5128 | Satt072 | 3 | 0.4867 |
AW132402 | 4 | 0.6756 | Satt309 | 3 | 0.5587 |
Satt453 | 6 | 0.7236 | Satt279 | 4 | 0.6493 |
Satt168 | 4 | 0.6072 | Satt571 | 4 | 0.6868 |
Satt396 | 3 | 0.5550 | Satt674 | 4 | 0.6400 |
Satt643 | 4 | 0.6981 | Satt242 | 5 | 0.5994 |
Satt184 | 5 | 0.7876 | Satt373 | 4 | 0.6949 |
Satt141 | 6 | 0.7587 | Satt551 | 5 | 0.6869 |
Satt301 | 6 | 0.8111 | Sat_379 | 4 | 0.4975 |
Satt685 | 2 | 0.4978 | Satt262 | 5 | 0.7556 |
遗传相似性系数可以反应不同大豆种质资源间的亲缘关系远近。利用NTSYS 2.10e软件对遗传相似性系数进行计算,结果表明58份耐盐大豆种质资源间的相似性系数在0.5385~0.9231,平均值为0.6974。其中遗传相似性系数最小的大豆种质资源有5对,分别为黑龙江的丰收12与北京的中黄10号、黑龙江的合丰50与山东的大粒黑豆、黑龙江的合丰50与国外的L-9、吉林的白城秣食豆与内蒙古的赤豆1号以及吉林的白城秣食豆与吉育303,遗传相似性系数均为0.5385,说明这5个组合种质资源间亲缘关系相对较远。遗传相似性系数在0.9000~0.9999之间数量最少,有2对。遗传相似性系数在0.6000~0.6999之间的组合有842对,占总数的46.01%,其次是在0.7000~0.7999之间,有772对,占总数的42.19%,说明58份大豆种质资源大部分遗传关系较近,遗传多样性较低。
基于遗传相似性系数,利用UPGMA法对58份耐盐大豆种质资源进行聚类分析并绘制树状图(

图5 58份耐盐大豆种质资源的UPGMA亲缘关系聚类分析
Fig.5 UPGMA phylogenetic cluster analysis of 58 salt-tolerant soybean germplasm resources
数字为品种序号,同表5,下同
The number represents the variety number which is the same as table 5,the same as below
基于遗传相似性系数计算大豆种质资源间的遗传距离,运用MEGA-X软件的N-J法对58份耐盐大豆种质资源进行聚类分析(

图6 58份耐盐大豆种质资源的N-J亲缘关系聚类分析
Fig.6 N-J relationship cluster analysis of 58 salt-tolerant soybean germplasm resources
大豆苗期耐盐鉴定结果可直接反应大豆全生育期耐盐水
张海燕
随着分子辅助育种技术的发展,分子标记技术也广泛应用于遗传多样性研
本研究使用UPGMA和NJ两种方法对58份耐盐大豆种质资源进行亲缘关系聚类分析,发现高耐盐等级大豆种质资源长农33、吉育303、龙豆5号、中黄48、五星4号和赫尔松2号在两种方法建立的亲缘关系聚类图中都聚集在同一类群,且58份大豆种质资源在两种方法建立的亲缘关系聚类图中地域划分不明显,但一个类群或亚群中大部分种质资源来源地在地理位置上相同或较为接近,说明UPGMA法与NJ法聚类结果具有一致
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