2025年5月18日 17:19 星期日
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陆地棉种质资源遗传多样性分析及优异种质筛选  PDF

    张文
    ✉
    逯涛
    ✉
    曾庆涛
    ✉
    王政洋
    杨芮
    赵富强
新疆生产建设兵团第七师农业科学研究所,奎屯 833200

最近更新:2024-07-04

DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20231206003

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摘要
关键词
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 性状调查
1.3 数据处理
2 结果与分析
2.1 主要性状的遗传多样性分析
2.2 主要性状的相关性分析
2.3 主成分分析
2.4 综合评价
2.5 主要性状的聚类分析
3 讨论
参考文献

摘要

种质资源是农业科技原始创新与现代种业发展的物质基础,优异种质为培育优良棉花品种提供了材料基础。本研究以230份棉花种质资源为材料,利用遗传多样性、相关性分析、主成分分析以及聚类分析等方法对其13个表型性状指标进行分析。结果表明,13个性状的变异系数在0.90%~22.43%之间,其中整齐度指数的变异系数最小,单株结铃数的变异系数最大。各表型性状的遗传多样性指数在1.92~2.07之间,马克隆值的遗传多样性指数最大,单株结铃数的遗传多样性指数最小。主成分分析结果显示,6个主成分的累计贡献率可达74.413%,其中第1主成分、第5主成分和第6主成分可合并为纤维品质因子,第2主成分、第3主成分可合并为棉花产量因子,第4主成分为植株性状因子。聚类分析把230份棉花种质资源材料分成3类,其中类群II是产量与纤维品质性状综合表现较好的类群。最后依据综合评价D值进行评价,初步筛选出29份表现较好的棉花品种,在育种工作中可根据育种目标对其进行针对性的改良。

关键词

棉花; 表型性状; 种质资源; 遗传多样性; 筛选

棉花是一种至关重要的经济作物和储备战略物资,在我国的社会经济中占据极其关键的位置[

参考文献 1
百度学术    
1]。新疆地处我国西北边陲,充裕的光热资源为棉花产业的快速发展奠定了优越的基础,当前,新疆已发展成为国内最大的优质棉与唯一的长绒棉产区,可以说,棉花是新疆经济的特色与支柱产业,与新疆农业的发展息息相关[
参考文献 2-3
2-3]。截至2022年,随着新疆植棉地位的不断提升,生产和市场对棉花育种工作也提出了更多更高的要求,而现有的品种与棉农的需求却不一致,也越来越不能适应生产与市场需求,因此,必须加大对高产优质抗逆棉花新品种的选育力度[
参考文献 4-5
4-5]。有学者发现,作物产量的增加与品种息息相关,品种对提高作物产量的贡献率可达到45%左右[
参考文献 6
百度学术    
6]。因此,种质资源的开发及利用与作物育种水平的提升息息相关。

然而,长期以来种质资源的研究和重视程度不够,投入的资金与科研力量缺乏,导致棉花种质资源在研究内容与技术方法上相对滞后,这成为限制棉花品种选育效率提高的关键[

参考文献 7-9
7-9]。特别是近些年来,由于育种进程的不断加快,棉花所用的种质资源基本集中在少数几个骨干亲本上,导致众多品种之间的亲缘相近,遗传基础狭窄[
参考文献 10-11
10-11]。因此收集、鉴定与创新利用遗传基础丰富的棉花种质资源,为棉花新品种的选育提供充裕的种质材料就显得至关重要。

本研究以230份来自不同地区的棉花种质资源为研究对象,针对果枝节位、株高、始果节高、单株结铃数、果枝数、单铃重、衣分、短绒率、断裂比强度、伸长率、马克隆值、整齐度指数和纤维长度等13个性状指标进行遗传多样性、相关性、主成分和聚类分析,筛选出优质种质,为棉花育种工作奠定资源基础。

1 材料与方法

1.1 试验材料

供试的棉花种质材料230份(详见https://doi.org/10.13430/j.cnki.jpgr. 20231206003,附表1),其中89份来自中国西北内陆棉区,12份来自中国黄河流域棉区,9份来自中国长江流域棉区,1份来自美国,119份来自前苏联。2022年230份材料种植于新疆兵团第七师农科所试验田,完全随机区组设计,一膜(即一个区组)六行,行长2 m、行距0.8 m、株距12.4 cm,2次重复,常规田间管理。

表1  供试种质资源性状的一般性描述及变异情况
Table 1  General description and variation of traits of tested germplasm resources

性状

Traits

极差

Range

极小值

Min.

极大值

Max.

均值

Mean

标准差Standard deviation变异系数(%) CV

遗传多样性指数

Genetic diversity index

株高(cm)PH 41.67 34.80 76.47 52.28 10.05 19.23 1.98
果枝数FBN 4.07 6.33 10.40 7.80 0.69 8.78 2.02
果枝节位SBN 1.87 4.07 5.93 5.05 0.26 5.21 1.94
始果节高(cm)IFNH 18.13 16.40 34.53 25.09 3.23 12.86 2.06
单株结铃数 BN 13.00 2.87 15.87 7.71 1.73 22.43 1.92
单铃重(g)BW 2.86 4.57 7.43 5.65 0.57 10.00 2.04
衣分(%)LP 13.86 36.07 49.93 44.48 2.26 5.08 2.02
纤维长度(mm)FL 6.23 28.18 34.41 30.84 1.09 3.53 2.05
整齐度指数(%)UI 4.40 82.77 87.17 85.42 0.77 0.90 2.01
马克隆值MIC 2.00 3.46 5.45 4.50 0.36 7.93 2.07
断裂比强度(cN/tex)BS 11.97 25.43 37.40 31.98 2.12 6.63 2.01
伸长率(%)FE 1.20 6.40 7.60 6.91 0.18 2.56 2.01
短绒率(%)SFI 2.67 5.60 8.27 6.81 0.33 4.81 1.95

PH: Plant height; FBN: Fruit branch number; SBN: Sympodial brand node; IFNH: Initial fruit node height; BN: Boll number; BW: Boll weight; LP: Lint percentage; FL: Fibre length; UI: Uniformity index; MIC: Micronaire; BS: Breaking strength; FE: Fiber elongation; SFI: Short fiber index; The same as below

1.2 性状调查

依照棉花种质资源描述规范和数据标准[

参考文献 12
百度学术    
12]进行表型数据采集,每小区选取边行、中行各5株(共15株),测定株高、果枝数、果枝节位、始果节高、单株结铃数等5个性状,收获前每小区选择正常吐絮单株收取中部棉铃30个,用于测定单铃重、衣分、纤维长度、整齐度指数、马克隆值、断裂比强度、伸长率、短绒率等8个性状,每个性状测定2次重复。

1.3 数据处理

利用WPS office整理试验数据,计算13个表型性状的描述性统计量和遗传多样性指数[

参考文献 13
百度学术    
13],利用SPSS20.0、R3.5.3语言软件进行性状相关性、主成分和系统聚类分析,结合隶属函数法对230份棉花种质材料进行综合评价[
参考文献 14-15
14-15]。

2 结果与分析

2.1 主要性状的遗传多样性分析

由表1可知,230份棉花种质资源不同性状间的变异范围在0.90%~22.43%之间,其中整齐度指数的变异系数最小;单株结铃数的变异系数最大。其他性状的变异系数依序为株高(19.23%)、始果节高(12.86%)、单铃重(10.00%)、果枝数(8.78%)、马克隆值(7.93%)、断裂比强度(6.63%)、果枝节位(5.21%)、衣分(5.08%)、短绒率(4.81%)、纤维长度(3.53%)、伸长率(2.56%)。棉花种质资源不同性状的遗传多样性指数在1.92~2.07之间,说明这230份棉花种质资源具有丰富的遗传多样性,遗传多样性指数从大到小依序为马克隆值(2.07)、始果节高(2.06)、纤维长度(2.05)、单铃重(2.04)、衣分(2.02%)、果枝数(2.02)、断裂比强度(2.01)、伸长率(2.01)、整齐度指数(2.01)、株高(1.98)、短绒率(1.95)、果枝节位(1.94)、单株结铃数(1.92)。变异系数与遗传多样性指数的计算结果并不完全相同,可能是因为变异系数强调的是性状的离散程度,而遗传多样性指数则强调的是不同层次分布的均匀度。

2.2 主要性状的相关性分析

230份棉花种质资源13个主要性状间存在复杂的相关关系(图1)。株高与单铃重呈极显著负相关,与马克隆值之间呈显著负相关,与整齐度指数呈极显著正相关,与断裂比强度呈显著正相关;果枝数与单株结铃数、断裂比强度呈极显著正相关,与伸长率呈显著正相关,与单铃重呈极显著负相关;果枝节位与始果节高、单株结铃数、衣分呈极显著正相关,与单铃重和伸长率呈显著正相关;始果节高与单株结铃数、衣分、纤维长度、整齐度指数呈极显著正相关,与断裂比强度和伸长率呈显著正相关,与短绒率呈极显著负相关,与马克隆值呈显著负相关;单株结铃数与伸长率呈极显著正相关,与断裂比强度呈显著正相关;单铃重与衣分、马克隆值呈极显著正相关;衣分与马克隆值呈极显著正相关;纤维长度与伸长率呈极显著正相关,与马克隆值、短绒率呈极显著负相关;整齐度指数与伸长率呈极显著正相关,与断裂比强度呈显著正相关,与短绒率呈极显著负相关;马克隆值与短绒率呈极显著正相关;断裂比强度与伸长率呈极显著正相关,与短绒率呈显著负相关;伸长率与短绒率呈极显著负相关。由此可见,棉花各性状间相关关系复杂,相互影响,相互制约,在进行棉花品种改良时,应充分考虑各性状间的相互关系,尤其需要考虑对负相关性状的影响。

图1  供试种质资源性状的相关性分析

Fig.1  Correlation analysis of traits of tested germplasm resources

*、**、***分别表示在0.05、0.01、0.001水平下显著相关

*, ** and *** indicated significant correlation at 0.05, 0.01 and 0.001 levels, respectively

2.3 主成分分析

将230份棉花种质资源的13个性状进行主成分分析,前6个主成分的累计贡献率达到74.413%,涵盖了性状的绝大多数信息(表2)。第1主成分的特征值2.983,贡献率22.946%,其中短绒率的特征向量(绝对值)最大,表明短绒率对第1主成分的作用最大,其次是纤维长度和伸长率,这些性状与纤维品质有关,因此,可把第1主成分称为纤维品质因子;第2主成分的特征值1.827,贡献率14.053%,其中衣分的特征向量最大,表明衣分对第2主成分的作用最大,其次是马克隆值和果枝节位,因此,第2主成分可称为衣分因子;第3主成分的特征值1.612,贡献率12.399%,其中果枝数的特征向量最大,表明果枝数对第3主成分的作用最大,其次是单株结铃数,因此,第3主成分可称为果枝数因子;第4主成分的特征值1.307,贡献率10.053%,株高的特征向量最大,表明株高对第4主成分的作用最大;第5主成分的特征值1.063,贡献率8.177%,其中马克隆值的特征向量最大,表明马克隆值对第5主成分的作用最大;第6主成分的特征值0.882,贡献率6.786%,其中断裂比强度的特征向量最大,表明断裂比强度对第6主成分的作用最大。

表2  供试种质资源性状的主成分分析
Table 2  Principal component analysis of the traits of tested germplasm resources

性状

Traits

主成分Principal components
123456
株高PH 0.241 -0.353 0.200 0.623 0.159 0.011
果枝数FBN 0.416 -0.028 0.757 -0.233 0.046 -0.184
果枝节位SBN 0.216 0.571 -0.020 0.152 -0.414 0.340
始果节高IFNH 0.561 0.325 -0.030 0.331 -0.477 -0.075
单株结铃数 BN 0.383 0.315 0.673 -0.291 -0.061 -0.187
单铃重BW -0.220 0.560 -0.351 -0.022 0.134 -0.081
衣分LP 0.057 0.672 -0.008 0.215 0.009 -0.212
纤维长度FL 0.765 -0.097 -0.395 -0.369 -0.067 -0.057
整齐度指数UI 0.493 -0.018 -0.025 0.593 0.327 -0.276
马克隆值MIC -0.287 0.610 0.079 -0.034 0.575 0.023
断裂比强度BS 0.380 0.022 0.279 0.147 0.188 0.712
伸长率FE 0.654 0.125 -0.197 -0.291 0.347 0.195
短绒率SFI -0.842 0.091 0.377 0.074 -0.129 0.123
特征值 Characteristic value 2.983 1.827 1.612 1.307 1.063 0.882
贡献率 Contributions rate 22.946 14.053 12.399 10.053 8.177 6.786
累计贡献率 Cumulative contributions rate 22.946 36.998 49.397 59.450 67.627 74.413

2.4 综合评价

把13个表型性状进行标准化处理,然后代入6个主成分,可得到各品种的6个主成分得分F,6个主成分的线性方程如公式(1)~(6)所示。

F1=0.241Z1+0.416Z2+0.216Z3+0.561Z4+0.383Z5-0.220Z6+0.057Z7+0.765Z8+0.493Z9-0.287Z10+0.380Z11+0.654Z12-0.842Z13 (1)
F2=-0.353Z1-0.028Z2+0.571Z3+0.325Z4+0.315Z5+0.560Z6+0.672Z7-0.097Z8-0.018Z9+0.610Z10+0.022Z11+0.125Z12+0.091Z13 (2)
F3=0.200Z1+0.757Z2-0.020Z3-0.030Z4+0.673Z5-0.351Z6-0.008Z7-0.395Z8-0.025Z9+0.079Z10+0.279Z11-0.197Z12+0.377Z13 (3)
F4=0.623Z1-0.233Z2+0.152Z3+0.331Z4-0.291Z5-0.022Z6+0.215Z7-0.369Z8+0.593Z9-0.034Z10+0.147Z11-0.291Z12+0.074Z13 (4)
F5=0.159Z1+0.046Z2-0.414Z3-0.477Z4-0.061Z5+0.134Z6+0.009Z7-0.067Z8+0.327Z9+0.575Z10+0.188Z11+0.347Z12-0.129Z13 (5)
F6=0.011Z1-0.184Z2+0.340Z3-0.075Z4-0.187Z5-0.081Z6-0.212Z7-0.057Z8-0.276Z9+0.023Z10+0.712Z11+0.195Z12+0.123Z13 (6)

式中Z1~Z13分别代表13个性状,把6个主成分的方差贡献率分别除以其累计贡献率可得各主成分的权重,分别为0.308、0.189、0.167、0.135、0.110、0.091,然后将主成分得分与其对应的权重值进行加权求和,得到综合评价D值公式,D=0.308×F1+0.189×F2+0.167×F3+0.135×F4+0.110×F5+0.091×F6,最终得出230份棉花种质材料的综合评价D值。结果显示(表3),D值大于0.600的棉花品种有29个,排在前6位的分别是金垦1441、新陆早80号、新石K18、金垦1402、新陆早13号、新石H16。这些品种株高、果枝数、单株结铃数等植株和产量性状表现较好,纤维品质表现较为突出。

表3  230份棉花种质材料的综合评价值及排序
Table 3  Comprehensive evaluation value and ranking of 230 cotton germplasm lines

序号

No.

品种名称

Variety

D值

D value

序号

No.

品种名称

Variety

D值

D value

序号

No.

品种名称

Variety

D值

D value

序号

No.

品种名称

Variety

D值

D value

1 金垦1441 0.746 9 新石K33 0.638 17 Z1112 0.618 25 新陆中88号 0.607
2 新陆早80号 0.708 10 惠远162 0.634 18 庄稼汉701 0.614 26 C4-16 0.606
3 新石K18 0.683 11 新陆早49号 0.628 19 酒棉10号 0.614 27 新早棉107 0.605
4 金垦1402 0.679 12 子鼎6号 0.627 20 C-4757 0.613 28 新陆早82号 0.605
5 新陆早13号 0.679 13 新陆早33号 0.626 21 新陆中80号 0.612 29 苏联棉34系 0.602
6 新石H16 0.671 14 新陆中81号 0.623 22 苏联棉29系 0.611
7 新陆中14号 0.663 15 KK-1543 0.623 23 苏联2302 0.610
8 金垦1565 0.640 16 新陆中56号 0.609 24 新陆早65号 0.621

其余201份棉花种质材料的综合评价值及排序详见https://doi.org/10.13430/j.cnki.jpgr. 20231206003,附表1

The comprehensive evaluation value and ranking of the remaining 201 cotton germplasm materials see https://doi.org/10.13430/j.cnki.jpgr.20231206003, Schedule 1 for details

2.5 主要性状的聚类分析

利用R语言对230份棉花种质资源进行系统聚类,在欧氏距离10.4处将其分成3个类群(图2),同时统计每个类群的性状平均值(表4)。第I类群包括62份种质,占种质资源的26.96%,其中西北内陆棉区种质资源53份,黄河流域棉区种质资源5份,长江流域棉区种质资源4份,该类群种质株高较高,果枝数较多,衣分较低,纤维长度相对较短,整齐度指数和断裂比强度较好。第II类群包含28份种质,占种质资源的12.17%,其中西北内陆棉区种质19份,黄河流域棉区种质2份,长江流域棉区种质2份,美国棉花种质1份,前苏联棉花种质4份,该类群种质材料株高、果枝数、衣分、整齐度指数、断裂比强度表现中等,单株结铃数最多,纤维长度最长,短绒率最低。第III类群包含140份种质,是最大的一个类群,占种质资源的60.87%,其中西北内陆棉区种质17份、黄河流域棉区种质5份、长江流域棉区种质4份、前苏联棉花种质114份,该类群株高、果枝数、单株结铃数、整齐度指数、断裂比强度相对较低,单铃重、衣分、短绒率相对较高。

图2  供试种质资源聚类图

Fig.2  Cluster analysis of tested germplasm resource

表4  不同类群13个性状表现
Table 4  The performance value of 13 traits in different groups

类群

Group

株高

(cm)

PH

果枝数

FBN

果枝

节位

SBN

始果节高(cm)

IFNH

单株结铃数

BN

单铃重(g)

BW

衣分

(%)

LP

纤维长度(mm)

FL

整齐度指数(%)UI

马克隆值

MIC

断裂比强度(cN/tex)

BS

伸长率(%)

FE

短绒率(%)

SFI

Ⅰ 66.39 7.90 5.06 25.18 7.74 5.51 43.96 30.65 85.79 4.46 32.34 6.90 6.79
Ⅱ 55.41 7.83 5.03 25.16 7.88 5.50 44.10 31.10 85.41 4.33 32.15 6.91 6.76
Ⅲ 45.41 7.75 5.04 25.04 7.66 5.74 44.79 30.87 85.25 4.56 31.78 6.91 6.84

3 讨论

表型性状分析是探索作物遗传多样性最有效也是最直观的方法[

参考文献 16
百度学术    
16]。其中,变异系数是评判作物种质资源遗传多样性的关键指标,变异系数越大,表征其变异程度越大,表明其遗传多样性越丰富,对于品种改良的潜能也就越大[
参考文献 17-18
17-18]。对230份棉花种质资源的13个性状的变异系数进行分析,发现除了纤维长度、整齐度指数、伸长率和短绒率外,其他9个性状的变异系数均大于5%,其中单株结铃数、株高、始果节高、单铃重的变异系数大于10%,这与王秀秀等[
参考文献 19
百度学术    
19]和李慧琴等[
参考文献 20
百度学术    
20]的研究较为一致。各性状的遗传多样性指数在1.92~2.07之间,说明这230份棉花种质资源具有丰富的遗传多样性。

相关性分析结果表明,果枝数与单株结铃数、断裂比强度呈极显著正相关,与伸长率呈显著正相关,与单铃重呈极显著负相关,说明果枝数越多,单株结铃数增加,断裂比强度和伸长率等品质指标也相应提高,但单铃重会有所降低;单株结铃数增加,断裂比强度和伸长率的值也会相应增加;单铃重越高,衣分越高、马克隆值越大,棉纤维越粗,成熟度越高;纤维长度越长,伸长率越长,马克隆值和短绒率越小,棉花纤维品质越好。这与王燕等[

参考文献 21
百度学术    
21]、王天友等[
参考文献 22
百度学术    
22]和钱玉源等[
参考文献 23
百度学术    
23]的部分结果一致。

鉴于陆地棉的表型性状较多,且性状之间具有复杂的相关关系,为了筛选出作物育种过程中较为关键的性状指标,可以通过主成分分析的方法把多个有相关关系的性状指标转化成彼此独立的综合指标[

参考文献 24
百度学术    
24]。将230份种质资源的 13个性状指标简化成 6个主成分,累计贡献率达到 74.413%,其中,第1主成分、第5主成分和第6主成分可合并为纤维品质因子,第2主成分、第3主成分可合并为棉花产量因子,第4主成分为植株性状因子。主成分分析结果体现了现阶段引种的主要关注点:首先是纤维品质(贡献率37.909%),其次是产量(贡献率26.452%),这与当前棉花育种的主要关注点一致[
参考文献 25
百度学术    
25]。

聚类分析是依据种质的性状特征,将性状相近的种质进行聚合,性状相差较大的种质则会划分到不同的类别。张磊磊等[

参考文献 26
百度学术    
26]利用聚类分析将647份海岛棉划分成6个类群,其中类群Ⅱ综合表现较好。热比耶等[
参考文献 27
百度学术    
27]通过聚类分析将288份陆地棉种质划分为4类,其中类群Ⅰ为马克隆值最好的材料,类群Ⅱ为衣分最高的材料,类群III为综合表现较好的材料,类群Ⅳ为特殊种质。金宇豪等[
参考文献 28
百度学术    
28]将390份陆地棉种质资源按纤维品质性状划分为4类,其中类群Ⅲ的纤维品质最好;按农艺性状划分为3类,其中类群Ⅲ的产量性状最好,结合农艺性状和纤维品质的聚类结果,挑选出10份综合状表现较好的种质材料。董承光等[
参考文献 29
百度学术    
29]通过田间性状、室内考种及纤维品质结果将429份陆地棉种质资源划分为10个类群,其中第Ⅰ类群包含330份种质,占种质资源的76.9%。本研究通过聚类分析将230份种质材料分成3个类群,类群I种质材料株高、果枝数、整齐度指数和断裂比强度较好,但衣分较低,纤维长度相对较短,例如金垦1441、新陆早80号、新石K18等,该类群可作为提高株高、增加果枝数的亲本材料加以利用,也可选择衣分高、纤维长度长的优良品种来改良。类群II的种质在地域上分布较为广泛,其株高、果枝数、衣分、整齐度指数、断裂比强度表现中等,单株结铃数最多,纤维长度最长,短绒率最低,例如新陆早33号、新陆中81号、酒棉17、湘X16326等,该类群可作为单株结铃数多、纤维长度长和短绒率低的亲本材料加以利用,也可以选择株高、果枝数、衣分、整齐度指数、断裂比强度表现较好的种质材料进行改良。类群III的种质材料株高、果枝数、单株结铃数、整齐度指数、断裂比强度较低,单铃重、衣分、短绒率较高,例如子鼎6号、KK1543等,该类群可作为单铃重和衣分较高的亲本材料加以利用,也可以选择单株结铃数、整齐度指数、断裂比强度高和短绒率低的优良种质进行改良。

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