2025年6月3日 15:52 星期二
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1775份水稻种质资源重要农艺性状遗传多样性研究  PDF

    金京花 1
    李淑芳 2
    赵亚东 1
    王迪 1
    张妤 1
    金国光 1
    李鹤南 3
    全成哲 1
    ✉
    张强 1
    ✉
1. 吉林省农业科学院水稻研究所,公主岭 136100; 2. 吉林省农业科学院作物资源研究所,公主岭 136100; 3. 山东农业大学植物保护学院,泰安 271018

最近更新:2025-03-07

DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20240602002

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EN 引
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目录contents
摘要
关键词
1 材料与方法
1.1 试验材料
1.2 试验方法
1.3 数据分析
2 结果与分析
2.1 水稻种质资源遗传多样性分析
2.2 水稻种质资源相关性分析
2.3 水稻种质资源主成分分析
2.4 水稻种质资源聚类分析
3 讨论
3.1 水稻种质资源重要农艺性状遗传差异
3.2 水稻种质资源表型性状综合评价
参考文献

摘要

水稻种质资源是水稻遗传改良及新品种选育的重要基础,研究水稻种质资源遗传多样性对拓宽稻种资源的遗传背景具有重要作用。本研究采用多种分析方法对1775份水稻种质资源的20个重要农艺性状进行了遗传多样性分析,发现所有种质资源农艺性状的变异系数差异较大,范围为4.42%(谷粒厚度)~89.75%(空粒数),空粒数具有较丰富的遗传变异;遗传多样性指数的变化范围为1.585(空粒数)~2.069(抽穗期),抽穗期具有较丰富的多样性。通过对11个省(市)种质的单独分析发现,吉林省种质的有效穗数及穗粒数等7个性状具有较丰富的多样性;云南省种质的始穗期及穗长等4个性状具有较丰富的多样性;黑龙江省种质的抽穗期等3个性状具有较丰富的多样性。对不同类型种质的分析发现,地方品种的剑叶长度、株高等11个性状具有较丰富的多样性,选育品种的生育期性状、有效穗数等9个性状具有较丰富的多样性。相关分析表明,149个相关系数达到极显著(P<0.01)水平,其中始穗期等3个生育期性状与其他农艺性状相关程度较高。主成分分析发现,前6个主成分累积贡献率达79.309%,且与生育期相关的性状贡献率最大。通过聚类分析,1775份水稻种质被划分成3个类群,其中东北三省及北京和杭州的种质为类群Ⅰ,该群种质的始穗期、分蘖数及有效穗数等10个性状的遗传多样性较丰富,可为今后水稻种质资源创新及新品种选育提供优异种质。第Ⅱ类群仅包含宁夏种质,说明宁夏种质资源与其他省(市)的种质资源亲缘关系较远,可为今后拓宽水稻种质资源遗传基础起到重要作用。第Ⅲ类群包含河北、山东、云南、江苏及新疆种质,此类群种质谷粒长度的遗传多样性较丰富,可为今后水稻品质育种提供丰富的种质。

关键词

水稻; 种质资源; 农艺性状; 遗传多样性

水稻是我国最重要的粮食作物之一,是全国60%以上人口的主食,稻米生产对保障我国粮食安全起到至关重要的作用[

参考文献 1
百度学术    
1]。吉林省地处高纬度,是北方粳稻主产区之一,也是我国主要的优质粳稻生产基地[
参考文献 2
百度学术    
2]。吉林省水稻种植面积常年稳定在80万公顷左右,产量是东北“三省一区”水稻总产量的四分之一,在东北乃至全国水稻生产中都具有重要地位[
参考文献 3
百度学术    
3]。水稻种质资源是水稻品种改良创新的基础,是维护水稻遗传多样性、推动水稻产业持续发展的重要保障[
参考文献 4
百度学术    
4]。水稻产量的大幅度提升离不开水稻优异种质资源的发掘与利用[
参考文献 5
百度学术    
5],矮秆资源“低脚乌尖”的使用掀起了水稻的第一次绿色革命,“野败”的发现实现了杂交稻的三系配套,白叶枯病抗性基因Xa23的发现育成了我国自有知识产权的抗性种质。因此,筛选水稻优异种质、挖掘其蕴含的优异基因是水稻育种创新研究亟待解决的重要问题。

近年来,随着气候环境变化、种植业结构调整、土地流转及城镇化速度加快等众多因素影响,农作物种质资源急剧减少,资源多样性面临严重威胁,种质资源的收集与高效利用迫在眉睫。自20世纪50年代开始,水稻育成品种已开始呈现遗传基础狭窄、类型单一,遗传多样性下降等趋势[

参考文献 6-7
6-7],针对这一问题,众多学者对水稻遗传多样性开展了大量研究。马作斌等[
参考文献 8
百度学术    
8]针对来源于不同国家的36份水稻品种,选取63对引物对其进行遗传多样性分析,结果表明水稻品种之间的遗传差异与纬度和地理距离关系较大。刘丹等[
参考文献 9
百度学术    
9]对来自东北三省的71份杂草稻和籼粳稻进行遗传基础及籼粳分化研究,发现东北地区杂草稻遗传多样性水平略高于当地栽培稻。阮仁超等[
参考文献 10
百度学术    
10]研究了5168份水稻地方品种,发现品种多样性是品种与环境相互作用的结果。陈峰等[
参考文献 11
百度学术    
11]针对102份山东水稻地方品种的农艺性状和品质性状开展了多样性分析,发现山东水稻地方品种的农艺性状和品质性状均具有广泛的多样性。汤翠凤等[
参考文献 12
百度学术    
12]对云南新收集的1189份地方品种的17个农艺性状进行了多样性分析,得出了云南稻作生态区及稻作民族间的差异和分布。陈丽等[
参考文献 13
百度学术    
13]对不同来源的60份粳稻的18个表型性状开展了遗传多样性分析,发现不同地区的稻种资源表型性状多样性指数变异较大。宋玥等[
参考文献 14
百度学术    
14]针对1777份中国普通野生稻的5个重要农艺性状开展了遗传多样性研究,发现中国普通野生稻具有丰富的遗传多样性,且野生稻的聚类关系与地理位置成正相关。

水稻表型性状偏多,且性状间相关程度错综复杂,如何从众多表型性状中快速确定关键性状,对水稻种质资源科学合理地评价是众多学者重点关注的研究内容。前人关于野生稻表型性状遗传多样性的研究众多,但是大规模针对栽培稻表型性状遗传多样性的研究较少。本研究通过对1775份栽培稻种质资源20个重要农艺性状的遗传多样性进行深入分析,为拓宽水稻遗传基础、优异种质资源发掘及高效利用等提供理论依据,也为今后水稻种质创新和新品种选育提供广泛的基础材料。

1 材料与方法

1.1 试验材料

从11个省(市)的3000份水稻自然群体中,选取在吉林能够正常成熟的1775份水稻种质资源为试验材料,共包含3种类型,其中高世代稳定品系74份、地方品种219份、选育品种1482份。所有材料均来源于“十三五”国家重点研发计划子课题“东北稻区水稻优异种质资源耐盐碱性等精准鉴定”,由吉林省农业科学院水稻研究所提供(表1)。

表1  供试水稻种质资源信息
Table 1  Information of rice germplasm resources

省(市)

Province(city)

数量 Number类型 Types

省(市)

Province(city)

数量 Number类型 Types

品系

Lines

地方品种Landrace选育品种Advanced cultivar

品系

Lines

地方品种Landrace选育品种Advanced cultivar
北京 Beijing 49 23 - 26 辽宁 Liaoning 477 - 58 419
杭州 Hangzhou 28 28 - - 宁夏 Ningxia 94 - 10 84
河北 Hebei 25 - 18 7 山东 Shandong 24 - 19 5
黑龙江 Heilongjiang 303 - 46 257 新疆 Xinjiang 29 - 13 16
吉林 Jilin 582 - 54 528 云南 Yunnan 134 - 1 133
江苏 Jiangsu 30 23 - 7

-:无数据

-:No data

1.2 试验方法

1.2.1 试验地概况

试验于2018-2019年完成,试验地点位于吉林省公主岭市吉林省农业科学院水稻研究所试验地(124°44′E,43°27′N),该地区的最高海拔为374.9 m。根据当地气温情况,每年4月初播种,秧棚内育苗后于5月中旬移栽,适期收获。据公主岭市气象局观测,水稻生育期间日平均气温17.6 ℃,平均降雨量88.5 mm,平均日照时数253.9 h,试验期间气温未出现异常现象(图1)。

图1  水稻种质生育期间气温及降雨状况

Fig. 1  Temperature and precipitation during the growth and development of rice

1.2.2 试验设计

试验田选择当地有代表性的土壤,肥力水平中等偏上、排灌方便、肥力均匀。所有种质资源按各省(市)分类,在省(市)间及种质间均采用顺序排列,设3次重复,小区行长3 m,行株距30 cm×20 cm,每份材料种植1行,每行栽种16株。待夜间温度稳定在13 ℃以上且秧苗长至3.5~4叶期时移载,每穴1苗,所有资源同期移栽,四周均设保护行,栽培管理措施同当地大田生产。

1.2.3 农艺性状测量

对1775份水稻种质资源的20个农艺性状进行观察及测量,每小区随机选取10株(除去边际效应)进行测量。生育期性状通过观察全小区获得,包括始穗期、抽穗期、齐穗期,同时计算每份种质抽穗期至始穗期、齐穗期至始穗期所需天数。其他农艺性状包括剑叶长度、剑叶宽度、剑叶长宽比、株高、分蘖数、穗长、穗颈长、谷粒长度、谷粒宽度、谷粒长宽比、谷粒厚度、穗数、穗粒数、空粒数、结实率、单株产量、千粒重。调查标准参考《水稻种质资源描述规范和数据标准》[

参考文献 15
百度学术    
15],所有性状均采用所得数据的2年平均值进行计算。

1.3 数据分析

采用Excel 2010软件计算变异系数(CV,coefficient of variation)及遗传多样性指数(H′,Shannon-Weaver index),通过平均值(X¯)及标准差(S)将每个性状划分为10级,从第1级Xi≤(X¯-2S) 到第10级Xi≥(X¯+2S),每0.5S为1级,每级的相对频率用来计算遗传多样性指数[

参考文献 16
百度学术    
16]。遗传多样性指数[
参考文献 17
百度学术    
17]公式:H'=-∑Pi×lnPi,其中Pi为某一性状第 i 级别时的频率。采用IBM SPSS 25进行主成分分析,计算各主成分得分;通过Oringin 2021软件对1775份种质资源进行聚类分析。

2 结果与分析

2.1 水稻种质资源遗传多样性分析

2.1.1 重要农艺性状的变异分析及遗传多样性分析

对1775份水稻种质的20个农艺性状进行统计分析(表2)发现,20个农艺性状的变异系数范围在4.42%~89.75%之间,其中谷粒厚度最小,空粒数最大。其余18个性状的变异系数排序依次为谷粒宽度<结实率<谷粒长度<始穗期<齐穗期<抽穗期<谷粒长宽比<千粒重<穗长<剑叶宽度<有效穗数<株高<剑叶长度<分蘖数<单株产量<穗粒数<剑叶长宽比<穗颈长。由此可见,空粒数在20个农艺性状中具有最丰富的遗传变异,其次为穗颈长、剑叶长宽比等。

表2  参试材料20个农艺性状的变异分析及遗传多样性分析
Table 2  Genetic diversity and variation analysis of 20 agronomic traits in tested materials

性状

Traits

最小值

Min.

最大值

Max.

极差

Range

平均值

Mean

标准差

SD

变异系数 (%)CV

遗传多样性

指数

H′

始穗期(d)FIHD 83.00 132.00 49.00 105.17 8.18 7.78 2.060
抽穗期(d)HD 86.00 140.00 54.00 107.93 8.63 7.99 2.069
齐穗期(d)FHD 79.00 140.00 61.00 109.60 8.76 7.98 2.056
剑叶长度(cm)FLL 13.65 56.83 43.18 25.84 4.83 18.68 1.974
剑叶宽度(cm)FLW 0.85 2.38 1.53 1.37 0.17 12.22 1.965
剑叶长宽比 FLWR 8.50 37.11 28.61 19.15 4.51 23.57 2.053
株高(cm)PH 69.43 148.25 78.82 101.98 13.10 12.84 1.926
分蘖数 TN 6.80 31.60 24.80 14.04 2.67 19.05 1.990
穗长(cm)PL 13.40 30.45 17.05 18.48 2.07 11.22 2.016
穗颈长(cm)NL -3.35 34.95 38.30 7.16 2.76 38.50 1.963
谷粒长度(mm)GL 5.51 9.90 4.40 6.85 0.49 7.20 2.019
谷粒宽度(mm)GW 2.38 3.70 1.33 3.09 0.18 5.98 2.059
谷粒长宽比 GLWR 1.82 3.86 2.04 2.24 0.23 10.45 1.880
谷粒厚度(mm)GT 3.87 5.56 1.69 4.47 0.20 4.42 2.052
有效穗数 PP 8.15 20.85 12.70 11.59 1.48 12.75 2.044
穗粒数 SPP 58.25 277.45 219.20 134.53 29.60 22.00 2.041
空粒数 ES 1.00 72.85 71.85 11.08 9.95 89.75 1.585
结实率(%)SSR 53.12 99.06 45.94 91.99 0.06 6.79 1.698
单株产量(g)GY 4.25 46.67 42.42 27.05 5.59 20.65 2.050
千粒重(g)TGW 13.29 37.75 24.47 24.49 2.56 10.46 2.054

FIHD:First heading date;HD:Heading date;FHD:Full heading date;FLL:Flag leaf length;FLW:Flag leaf width;FLWR:Ratio of length to width for flag;PH:Plant height;TN:Tillering number;PL:Panicle length;NL:Neck length;GL:Grain length;GW:Grain width;GLWR:Ratio of length to width for grain;GT:Grain thickness;PP:Panicles per plant;SPP:Spikelets per panicle;ES:Empty seed;SSR:Seed setting rate;GY:Grain yield per plant;TGW:Thousand-grain weight;The same as below

遗传多样性指数变化范围在1.585~2.069之间,其中空粒数最小,抽穗期最大,其余性状的遗传多样性指数排序依次为结实率<谷粒长宽比<株高<穗颈长<剑叶宽度<剑叶长度<分蘖数<穗长<谷粒长度<穗粒数<有效穗数<单株产量<谷粒厚度<剑叶长宽比<千粒重<齐穗期<谷粒宽度<始穗期。由此可见,抽穗期在20个农艺性状中遗传多样性最丰富。

2.1.2 来源于不同省(市)资源的重要农艺性状差异

对来自11个省(市)种质的生育期性状进行差异显著性分析(表3、图2)发现,来自黑龙江省种质的始穗期、抽穗期及齐穗期平均值均小于其他省(市),且与其他省(市)种质均存在显著性差异;江苏省种质的始穗期、抽穗期及齐穗期平均值均大于其他省(市),且与除云南省外的其他9个省(市)的种质差异显著,说明黑龙江省种质的生育期在吉林省较短,江苏省种质的生育期在吉林省较长,这可能是由于不同地区积温差异所致,南种北引导致生育期延长,北种南引导致生育期缩短。黑龙江省种质的始穗-抽穗天数最短,仅需2.2 d,与除杭州、新疆外的其他8个省(市)的种质差异显著;江苏省种质的始穗-抽穗天数最长,平均4.6 d,说明黑龙江省的种质在吉林省表现抽穗较快,江苏省的种质抽穗则较慢。黑龙江省种质的始穗-齐穗天数最短,仅需2.7 d,云南省种质的始穗-齐穗天数最长,为5.8 d,说明黑龙江省的种质在吉林省表现抽穗较快、较整齐,而云南省种质的齐穗期历时较长。水稻种质的生育期与产量高度相关[

参考文献 7
百度学术    
7],因此,在对上述11个省(市)的种质利用时,应充分考虑生育期性状,做到合理利用。

表3  11个省(市)水稻种质资源生育期性状分析
Table 3  Analysis of growth stage traits of rice germplasm resources from 11 provinces(cities)

省(市)

Province(city)

始穗期(d)

FIHD

抽穗期(d)

HD

齐穗期(d)

FHD

始穗-抽穗天数(d)FIHD-HD始穗-齐穗天数(d)FIHD-FHD
北京 Beijing 109.0±5.11cd 112.2±5.37cd 113.5±5.73cd 3.2±1.53bcde 4.5±1.52bcde
杭州 Hangzhou 106.7±5.02de 110.4±5.13de 111.2±5.67ef 3.7±0.90cdef 4.5±1.20bcde
河北 Hebei 106.0±6.70ef 109.9±7.64ef 110.1±7.67de 3.9±2.12abc 4.1±1.27cde
江苏 Jiangsu 117.8±7.36a 122.4±7.64a 123.4±7.83a 4.6±2.18a 5.6±1.75abc
宁夏 Ningxia 103.8±3.79fg 106.7±4.07fg 107.9±4.13g 2.9±0.99cde 3.8±1.08de
山东 Shandong 114.5±7.25b 118.7±8.36b 119.3±8.30b 4.2±2.26ab 4.8±1.96ab
新疆 Xinjiang 104.6±6.86eg 107.1±7.34eg 108.7±7.27fg 2.5±1.06def 4.1±0.96de
云南 Yunnan 116.7±5.62ab 121.2±5.59ab 122.5±6.42ab 4.5±1.66bc 5.8±2.29a
黑龙江 Heilongjiang 94.2±5.10h 96.4±4.92h 96.9±4.89h 2.2±1.08f 2.7±1.37e
吉林 Jilin 102.6±3.92g 105.9±4.17g 106.6±4.38g 3.3±1.68e 4.0±2.27e
辽宁 Liaoning 110.4±4.52c 113.5±4.57c 114.3±5.05c 3.1±1.17cd 3.9±1.17bcd

数据后不同小写字母表示不同来源水稻种质资源在5%水平上差异显著;下同

Different lowercase letters after the data indicate significant differences from the rice germplasm resources at the 5% level; FIHD-HD:First heading date-Heading date;FIHD-FHD:First heading date-Full heading date;The same as below

  (图2)

  

图2  11个省(市)种质资源20个重要农艺性状分析

Fig. 2  Analysis of 20 important agronomic traits of germplasm resources from eleven provinces(cities)

针对除生育期外的其他17个农艺性状的比较分析(图2)发现,黑龙江省种质的有效穗数在11个省(市)中最多,为12.26个;结实率最高,为94.30%。江苏省种质的分蘖数最多,为15.28个。宁夏种质的剑叶长度、剑叶长宽比、穗颈长、穗粒数平均值均最大,分别为32.62 cm、24.12、9.72 cm、157.7粒。北京种质的剑叶长最小,为23.14 cm;谷粒长度最短,为6.64 mm;谷粒厚度最小,为4.39 mm。杭州种质的剑叶宽度、千粒重及单株产量平均值均最大,分别为1.44 cm、26.44 g、30.50 g;株高平均值最小,为91.64 cm;穗长最短,为17.03 cm。山东省种质与其他省(市)种质相比,株高最高,为122.51 cm;穗长最长,为20.28 cm;穗颈长最短,为4.66 cm。新疆种质的谷粒长度、谷粒长宽比、谷粒厚度平均值均最大,分别为7.67 mm、2.49、4.75 mm。吉林省种质的谷粒宽度最小,为3.06 mm。云南省种质的谷粒宽度最宽,为3.22 mm;空粒数最多,为21.7粒;剑叶宽度最小,为1.30 cm。河北省种质的穗粒数最少,为120.49粒。上述分析可以为后续不同的水稻育种目标提供基础材料,如矮秆育种可以选择杭州的种质,高秆大穗型品种可以选择山东省的种质,大粒型品种可以选择新疆种质。

对11个省(市)种质资源的遗传多样性分析(表4)发现,20个农艺性状的遗传多样性指数最大值分别出现在8个省(市)的种质资源中。北京种质分蘖数的遗传多样性指数值最大;杭州种质剑叶长度的遗传多样性指数值最大;新疆种质齐穗期的遗传多样性指数值最大;黑龙江省种质的抽穗期、剑叶长宽比、谷粒长宽比共3个性状的遗传多样性指数值最大;吉林省种质的剑叶宽度、穗颈长、谷粒厚度、有效穗数、穗粒数、空粒数及结实率共7个性状的遗传多样性指数值最大;云南省种质的始穗期、穗长、谷粒长度及谷粒宽度共4个性状的遗传多样性指数值最大;宁夏种质的株高及千粒重的遗传多样性指数值最大。由此可见,各省(市)种质的遗传多样性表现并不均匀,北京种质的分蘖数具有较丰富的遗传多样性;杭州种质的剑叶长度具有较丰富的遗传多样性;新疆种质的齐穗期具有较丰富的遗传多样性;黑龙江省种质的抽穗期等3个性状遗传多样性较丰富;吉林省种质的剑叶宽度等7个性状具有较丰富的遗传多样性;云南省种质的始穗期等4个性状具有较丰富的遗传多样性;宁夏种质的株高及千粒重2个性状具有较丰富的遗传多样性。

表4  11个省(市)水稻种质资源遗传多样性指数
Table 4  Genetic diversity index of rice germplasm resources from 11 provinces(cities)

性状

Traits

云南

Yunnan

江苏

Jiangsu

河北

Hebei

山东

Shandong

新疆

Xinjiang

黑龙江

Heilongjiang

吉林

Jilin

辽宁

Liaoning

北京

Beijing

杭州

Hangzhou

宁夏

Ningxia

始穗期 FIHD 2.065 1.953 1.826 1.752 1.843 2.057 1.987 2.030 1.778 1.837 1.934
抽穗期 HD 2.020 1.972 1.836 1.850 1.946 2.035 1.960 1.990 1.880 1.809 1.919
齐穗期 FHD 1.929 1.981 1.860 1.784 1.996 1.957 1.947 1.992 1.786 1.926 1.844
剑叶长度 FLL 1.833 1.933 1.992 1.831 1.855 1.919 1.818 1.815 1.989 2.011 1.997
剑叶宽度 FLW 1.904 1.867 1.477 1.676 1.990 1.889 2.013 1.993 1.980 1.911 1.462
剑叶长宽比 FLWR 2.011 1.781 2.034 1.812 1.703 2.041 2.028 1.976 1.865 1.761 1.892
株高 PH 1.983 1.946 1.844 1.657 1.992 2.007 2.012 1.880 1.939 1.868 2.032
分蘖数 TN 2.027 1.761 1.968 1.897 2.022 1.944 1.952 1.938 2.028 1.956 1.710
穗长 PL 2.086 2.028 1.912 1.896 1.870 2.046 1.984 2.013 1.937 1.398 1.973
穗颈长 NL 1.887 1.899 1.881 1.886 1.848 1.981 2.014 1.853 1.781 1.986 1.661
谷粒长度 GL 2.062 2.015 1.894 1.989 1.978 2.012 2.037 1.962 1.796 1.520 1.925
谷粒宽度 GW 2.105 1.932 1.857 1.889 2.044 2.088 1.989 2.017 2.027 1.939 1.806
谷粒长宽比 GLWR 2.028 2.006 1.984 1.803 1.954 2.055 2.019 2.044 1.969 1.999 2.039
谷粒厚度 GT 1.930 1.800 1.755 1.733 1.818 1.946 2.056 1.977 1.733 1.507 2.010
有效穗数 PP 2.033 1.864 1.921 1.810 2.011 2.035 2.060 2.040 2.043 1.806 1.917
穗粒数 SPP 1.833 1.605 1.676 1.436 1.709 1.782 2.073 1.871 1.853 1.386 1.867
空粒数 ES 2.039 1.999 1.957 1.664 1.852 2.027 2.073 1.998 1.924 2.017 2.000
结实率 SSR 1.970 1.651 1.968 1.830 1.810 2.017 2.075 2.072 1.980 1.968 2.051
单株产量 GY 1.636 1.924 1.387 1.534 1.733 1.547 1.746 1.562 1.837 1.351 1.899
千粒重 TGW 1.851 1.809 1.722 1.490 1.909 1.723 1.769 1.756 1.789 1.431 1.916

2.1.3 重要农艺性状种质类型间差异

对3类种质进行了多样性分析(表5),发现品系的始穗期、抽穗期、齐穗期、剑叶宽度、谷粒宽度及空粒数共6个性状的平均值在3类种质间最大;地方品种的剑叶长度、剑叶长宽比、株高、分蘖数、穗长、穗颈长、谷粒长度、谷粒厚度及千粒重共9个性状的平均值在3类种质间最大;选育品种的谷粒长宽比、有效穗数、穗粒数、结实率及单株产量共5个性状的平均值在3类种质间最大。品系的变异系数变化范围在4.33%(谷粒厚度)~76.43%(空粒数)之间,其中剑叶长度、剑叶长宽比、株高、谷粒长宽比、穗粒数及结实率的变异系数在3类种质间最大;地方品种的变异系数变化范围在5.08%(结实率)~61.63%(空粒数)之间,始穗期、抽穗期、剑叶宽度、穗颈长、谷粒长度、谷粒厚度、千粒重及单株产量的变异系数在3类种质间最大;选育品种的变异系数变化范围在4.08%(谷粒厚度)~92.92%(空粒数)之间,其中齐穗期、分蘖数、穗长、谷粒宽度、有效穗数及空粒数的变异系数在3类种质间最大。品系的遗传多样性指数变化范围在1.490(谷粒长宽比)~2.070(单株产量)之间,其中穗颈长的遗传多样性指数在3类种质中最大;地方品种的遗传多样性指数变化范围在1.786(剑叶宽度)~2.081(单株产量)之间,其中剑叶长宽比、株高等11个性状的遗传多样性指数在3类种质中最大;选育品种的遗传多样性指数变化范围在1.573(空粒数)~2.081(始穗期)之间,其中始穗期、抽穗期及齐穗期等9个性状的遗传多样性指数在3类种质中最大。

表5  不同类型种质重要农艺性状的变异分析和遗传多样性分析
Table 5  Genetic diversity and variation analysis of important agronomic traits in different germplasm types

性状

Traits

平均值 Mean变异系数 (%)CV遗传多样性指数H′

品系

Lines

地方品种Landrace选育品种Advanced cultivar

品系

Lines

地方品种

Landrace

选育品种

Advanced cultivar

品系

Lines

地方品种

Landrace

选育品种Advanced cultivar
始穗期(d)FIHD 109.82 102.12 105.38 6.15 7.87 7.71 1.829 2.012 2.081
抽穗期(d)HD 113.17 104.96 108.10 6.64 8.26 7.88 1.975 2.003 2.068
齐穗期(d)FHD 114.59 106.52 109.80 6.58 7.82 7.95 1.881 2.016 2.061
剑叶长度(cm)FLL 24.83 30.49 25.21 26.03 15.15 17.32 1.801 2.077 2.039
剑叶宽度(cm)FLW 1.42 1.31 1.38 10.16 13.56 11.97 1.942 1.786 1.958
剑叶长宽比 FLWR 17.70 23.60 18.56 29.85 18.42 22.12 1.625 2.068 2.033
株高(cm)PH 97.79 119.93 99.54 12.98 12.85 10.45 1.867 2.035 1.975
分蘖数 TN 13.28 14.49 14.01 18.76 13.16 19.76 1.844 2.008 1.976
穗长(cm)PL 18.25 19.93 18.27 10.36 10.67 10.88 1.983 2.038 2.010
穗颈长(cm)NL 6.34 8.20 7.05 39.01 42.08 37.12 2.014 1.929 1.959
谷粒长度(mm)GL 6.85 6.94 6.84 8.01 9.41 6.75 1.899 1.966 1.943
谷粒宽度(mm)GW 3.15 3.14 3.08 4.48 5.24 6.10 1.848 2.050 2.074
谷粒长宽比 GLWR 2.19 2.22 2.24 10.97 9.89 10.50 1.490 1.930 1.875
谷粒厚度(mm)GT 4.51 4.53 4.46 4.33 6.10 4.08 2.048 2.024 2.074
有效穗数 PP 11.50 11.40 11.62 11.40 9.94 13.14 2.020 1.948 2.044
穗粒数 SPP 137.18 115.60 137.20 22.59 20.80 21.33 1.855 2.032 2.047
空粒数 ES 12.28 9.84 11.21 76.43 61.63 92.92 1.544 1.853 1.573
结实率(%)SSR 90.93 91.57 92.10 7.04 5.08 6.98 1.747 1.885 1.574
单株产量(g)GY 26.43 20.23 28.09 22.90 30.71 16.66 2.070 2.081 2.077
千粒重(g)TGW 24.39 25.15 24.40 12.51 13.17 9.79 1.998 2.043 2.024

2.2 水稻种质资源相关性分析

参试材料农艺性状的相关性分析(图3)表明,20个农艺性状间的86个正相关系数、63个负相关系数共计149个相关系数达到极显著水平,其中正相关系数最大值0.983,负相关系数最大值-0.002。相关程度较高的性状有始穗期、抽穗期、齐穗期、剑叶长度、剑叶长宽比、株高及穗长等性状。始穗期、抽穗期及齐穗期三者互为极显著正相关,且三者均与剑叶长度、株高及穗长等9个性状呈极显著正相关,与剑叶宽度、分蘖数等5个性状呈极显著负相关。剑叶长度与其他农艺性状的相关程度也较高,如剑叶长度与株高、分蘖数及单株产量等10个性状呈极显著正相关,与剑叶长宽比、谷粒宽度及千粒重均呈极显著负相关。分蘖数、株高及穗长3个性状之间互为极显著正相关,且株高及穗长与谷粒长度、结实率及单株产量等7个性状呈极显著正相关,与谷粒宽度及千粒重呈极显著负相关。有效穗数与穗长、谷粒长、谷粒长宽比及空粒数等性状呈极显著正相关,与穗颈长、结实率及千粒重等6个性状呈极显著负相关。可见,水稻表型性状之间相关程度较高,相关关系错综复杂。

图3  参试材料20个农艺性状的相关性分析

Fig. 3  The correlation analysis of 20 agronomic traits in tested materials

*、**分别表示在 5%、1%水平上显著相关

*, ** indicates significant correlation at the 5%, 1% levels, respectively

2.3 水稻种质资源主成分分析

对1775份水稻种质资源20个农艺性状进行主成分分析(表6),选择特征值>1的前6个主成分,累积贡献率达79.309%。第1主成分贡献率最大,为23.729%,其中始穗期、抽穗期及齐穗期的特征值相同,且在第1主成分中最高,说明第1主成分主要是与生育期相关的性状。第2主成分贡献率是17.085%,剑叶长宽比的特征值最高,其次为剑叶长度,说明第2主成分是与剑叶相关的性状。第3主成分贡献率是11.190%,其中有效穗数正向特征值最大,其次为分蘖数,说明第3主成分是与产量相关的性状。第4主成分贡献率是10.058%,其中谷粒厚度特征值最大,其次是谷粒宽度,第5主成分贡献率是9.545%,其中谷粒长宽比正向特征值最大,谷粒宽度负向特征值最大,说明第4和第5主成分均反映谷粒相关特征。第6主成分贡献率是7.701%,其中空粒数正向特征值最大,结实率负向特征值最大,说明第6主成分是与籽粒产量相关的综合反应。

表6  参试材料20个农艺性状的主成分分析
Table 6  Principal component analysis of 20 agronomic traits in tested materials

性状

Traits

主成分1

PC1

主成分2

PC2

主成分3

PC3

主成分4

PC4

主成分5

PC5

主成分6

PC6

始穗期 FIHD 0.151 -0.127 0.187 0.043 0.050 -0.178
抽穗期 HD 0.151 -0.123 0.188 0.043 0.046 -0.184
齐穗期 FHD 0.151 -0.123 0.187 0.050 0.050 -0.181
剑叶长度 FLL 0.121 0.162 -0.011 -0.190 -0.098 -0.041
剑叶宽度 FLW 0.029 -0.184 -0.197 0.037 -0.122 0.039
剑叶长宽比 FLWR 0.083 0.217 0.102 -0.168 -0.015 -0.057
株高 PH 0.139 0.095 0.015 -0.141 -0.096 -0.053
分蘖数 TN -0.065 0.130 0.202 -0.017 0.151 0.127
穗长 PL 0.128 0.123 -0.091 -0.171 -0.031 0.022
穗颈长 NL -0.003 0.055 -0.061 -0.233 -0.102 0.115
谷粒长度 GL 0.116 0.090 -0.188 0.175 0.267 -0.003
谷粒宽度 GW 0.013 0.097 0.118 0.271 -0.360 0.013
谷粒长宽比 GLWR 0.075 0.007 -0.212 -0.040 0.417 -0.005
谷粒厚度 GT 0.106 0.137 -0.076 0.324 -0.012 -0.002
有效穗数 PP -0.094 0.101 0.232 0.055 0.188 0.151
穗粒数 SPP 0.066 -0.165 -0.153 -0.161 -0.133 0.159
空粒数 ES 0.128 -0.054 0.042 0.039 -0.025 0.476
结实率 SSR -0.126 0.015 -0.098 -0.079 -0.013 -0.457
单株产量 GY -0.062 -0.082 0.045 0.046 0.093 0.155
千粒重 TGW 0.012 0.108 -0.220 0.270 -0.103 -0.059
特征值 Eigenvalue 4.746 3.417 2.238 2.012 1.909 1.540
贡献率(%)Contribution rate 23.729 17.085 11.190 10.058 9.545 7.701
累积贡献率(%)Cumulative contribution rate 23.729 40.815 52.005 62.062 71.607 79.309

PC:Principal component

2.4 水稻种质资源聚类分析

通过对20个重要农艺性状的聚类分析发现,聚类结果与主成分分析的结果基本一致,可以把来自11个省(市)的1775份水稻种质资源划分成3个类群(图4),类群Ⅰ包含东北三省及北京和杭州,类群Ⅱ仅包含宁夏,类群Ⅲ则包含河北、山东、云南、江苏及新疆。根据3个类群的划分分别计算了每个类群的平均值、变异系数及遗传多样性指数(表7),发现类群Ⅰ种质的剑叶宽度、有效穗数、结实率及单株产量的平均值在3个类群中最大;剑叶长度、剑叶长宽比及空粒数的变异系数在3个类群中最大;始穗期、抽穗期及齐穗期等10个性状的遗传多样性指数在3个类群中最大。针对类群Ⅰ的分析说明该类群种质在吉林省公主岭市种植条件下,具有较高的单株产量;剑叶长度、剑叶长宽比及空粒数具有较丰富的遗传变异;始穗期等10个性状具有较丰富的遗传多样性。类群Ⅰ种质可为高产等目标性状育种提供丰富的基础材料。类群Ⅱ种质的剑叶长度、分蘖数、穗长、谷粒长度、穗粒数及千粒重等9个性状具有最高的平均值;剑叶宽度、有效穗数及单株产量等5个性状的变异系数在3个类群中最大;剑叶长度、株高及穗长等9个性状的遗传多样性指数在3个类群中最大。针对类群Ⅱ的分析说明该类群种质为大穗、长粒型,且剑叶宽、有效穗数及单株产量等5个性状具有丰富的遗传变异;剑叶长度、株高及穗长等9个性状具有较丰富的遗传多样性。类群Ⅱ种质可为大穗、长粒型品种选育提供丰富的基础材料,该类种质的高效利用可以拓宽水稻种质资源遗传基础,改善材料不丰富现象。类群Ⅲ种质的始穗期、抽穗期、齐穗期及株高等7个性状具有最高的平均值;始穗期等12个性状的变异系数在3个类群中最高;谷粒长度的遗传多样性指数在3个类群中最大。针对类群Ⅲ的分析说明该类群种质的株高较高、生育期较长,空粒数较多;始穗期等12个性状具有丰富的遗传变异;谷粒长度具有较丰富的遗传多样性。类群Ⅲ种质可以为晚熟品种选育提供丰富的基础材料。

图4  水稻种质资源类群划分

Fig. 4  Classification of rice germplasm resources

表7  3个类群种质变异分析及遗传多样性分析
Table 7  Genetic diversity and variation analysis of germplasm from 3 clusters

性状

Traits

类群Ⅰ First cluster类群Ⅱ Second cluster类群Ⅲ Third cluster
平均值 Mean

变异系数(%)

CV

遗传多样性指数

H′

平均值 Mean

变异系数(%)

CV

遗传多样性指数

H′

平均值 Mean

变异系数(%)

CV

遗传多样性指数

H′

始穗期(d)FIHD 104.61 4.58 1.938 103.78 3.66 1.934 111.94 6.09 1.888
抽穗期(d)HD 107.31 4.53 1.935 106.69 3.89 1.919 115.65 6.34 1.925
齐穗期(d)FHD 109.00 4.72 1.922 107.60 4.68 1.844 116.99 6.43 1.910
剑叶长度(cm)FLL 24.40 19.21 1.910 32.62 9.50 1.997 27.32 16.97 1.889
剑叶宽度(cm)FLW 1.40 9.59 1.957 1.37 13.52 1.462 1.36 12.32 1.783
剑叶长宽比 FLWR 17.68 22.39 1.934 24.12 12.48 1.892 20.46 21.62 1.868
株高(cm)PH 97.33 10.22 1.941 108.98 7.61 2.032 115.08 13.53 1.884
分蘖数 TN 13.69 16.84 1.964 14.78 12.80 1.710 13.78 19.70 1.935
穗长(cm)PL 18.02 9.81 1.876 20.19 8.32 1.973 19.61 9.92 1.959
穗颈长(cm)NL 6.72 35.38 1.923 9.72 35.19 1.661 6.20 47.15 1.880
谷粒长度(mm)GL 6.84 6.92 1.865 7.18 6.99 1.925 7.17 7.38 1.988
谷粒宽度(mm)GW 3.09 5.57 2.012 3.06 6.64 1.806 3.15 5.43 1.965
谷粒长宽比 GLWR 2.23 10.30 2.017 2.37 11.58 2.039 2.30 10.49 1.955
谷粒厚度(mm)GT 4.47 3.85 1.844 4.56 4.21 2.010 4.63 4.24 1.807
有效穗数 PP 11.59 11.71 1.997 10.34 12.97 1.917 11.40 10.75 1.928
穗粒数 SPP 135.23 18.71 1.793 157.74 25.30 1.867 125.94 26.09 1.652
空粒数 ES 10.27 76.46 2.008 13.22 57.66 2.000 16.62 69.07 1.902
结实率(%)SSR 93.00 5.39 2.022 91.71 4.42 2.051 87.18 8.76 1.846
单株产量(g)GY 27.81 18.21 1.609 26.80 23.53 1.899 22.41 22.90 1.643
千粒重(g)TGW 24.75 9.25 1.693 26.28 10.04 1.916 24.13 13.72 1.756

3 讨论

据人民日报2022年报道[

参考文献 18
百度学术    
18],良种对于粮食增产的贡献率已超过45%,良种的育成离不开优异种质资源的发掘与利用。育种工作中由于少数种质资源的高频次使用,导致育成品种遗传基础越来越狭窄,全成哲等[
参考文献 7
百度学术    
7]分析吉林省近年来审定的73份水稻品种遗传多样性发现,这些审定品种中近50%的品种有吉粳88血缘,甚至个别品种的双亲均有吉粳88血缘,这也间接导致了吉林省近年审定水稻品种的单一化现象较为严重。虽然拥有大量的种质资源,但并不代表它们具有丰富的遗传多样性。遗传多样性是衡量某一物种种内或种间遗传变异的一个重要指标[
参考文献 11
百度学术    
11]。因此,研究种质资源的遗传多样性可以辅助了解其遗传信息及变异概率[
参考文献 19
百度学术    
19],为育种及遗传改良奠定基础。稻种资源是改良、创新及选育水稻新品种的基础材料,研究水稻种质资源的遗传多样性可以为发掘有利基因提供一定的参考和理论依据。

3.1 水稻种质资源重要农艺性状遗传差异

本研究针对1775份水稻种质资源20个重要农艺性状的分析发现,这些性状间均存在不同程度的变异。张小利等[

参考文献 20
百度学术    
20]研究认为,变异系数越大,遗传变异越丰富,品种改良时可利用的潜力就越大。孙铭等[
参考文献 21
百度学术    
21]、田朋佳等[
参考文献 22
百度学术    
22]的研究均认为当变异系数大于10.00%时,样本间存在的差异较大。本研究20个农艺性状的变异系数变化范围在4.42%(谷粒厚度)~89.75%(空粒数)之间,其中穗颈长、剑叶长宽比、单株产量、穗粒数及空粒数共5个性状的变异系数均大于20.00%,株高、分蘖数、有效穗数、穗长、剑叶长度、剑叶宽度、千粒重及谷粒长宽比共8个性状的变异系数均大于10.00%,说明这13个性状的遗传变异较丰富,这一研究结果与刘文静等[
参考文献 23
百度学术    
23]、李振姣等[
参考文献 24
百度学术    
24]、陈越等[
参考文献 25
百度学术    
25]的研究结果基本一致。遗传多样性指数变化范围在1.585(空粒数)~2.069(抽穗期)之间,平均值为1.978,其中13个性状的遗传多样性指数均大于平均值,且这些性状均与产量相关,说明与产量相关的性状遗传多样性较丰富,这一研究结果与全成哲等[
参考文献 7
百度学术    
7]、刘文静等[
参考文献 23
百度学术    
23]、金建楚[
参考文献 26
百度学术    
26]的研究结果基本相同。

始穗期、抽穗期及齐穗期决定了水稻在种植地区的适应性,且始穗-齐穗天数能直观反应水稻的整齐度,是影响产量的重要农艺性状[

参考文献 27
百度学术    
27]。本研究通过11个省(市)种质的生育期性状对比分析发现,黑龙江省的种质在吉林省表现抽穗较早、较快,且抽穗整齐,尤其是牡丹江25,抽穗快、整齐,千粒重较高,空粒数少,结实率高达97%,其余性状表现均优异;江苏省的种质在吉林省表现偏晚,抽穗历时较长;云南省的种质齐穗历时较长;宁夏的种质在吉林省表现抽穗较快、较整齐,尤其是宁粳28、宁粳41等育成品种的始穗-齐穗天数仅需3.8 d。生育期性状的对比分析可为今后不同生育期水稻种质改良提供理论支撑。针对20个农艺性状的分析发现,这些种质的农艺性状表现各异,导致多样性也不尽相同。20个农艺性状的遗传多样性指数最大值分布在8个省(市),其中吉林省种质资源有效穗数、穗粒数等7个性状的遗传多样性指数在11个省(市)中最大,说明吉林省种质在有效穗数、穗粒数等性状方面具有较丰富的遗传多样性。云南省种质的始穗期、穗长等4个性状的遗传多样性指数在11个省(市)中最大,说明云南省种质在始穗期等4个性状方面具有较丰富的遗传多样性。黑龙江省种质的抽穗期、剑叶长宽比、谷粒长宽比共3个性状的遗传多样性指数大于其他省(市),说明黑龙江省种质的抽穗期等3个性状具有较丰富的遗传多样性。宁夏种质株高及千粒重的遗传多样性指数大于其他省(市),说明宁夏种质的株高及千粒重2个性状的遗传多样性优于其他省(市)。通过对不同地理来源种质遗传多样性的分析,可为今后水稻目标性状育种提供广泛的亲本材料。

对不同类型种质单独分析发现,不同类型种质的性状变异系数与遗传多样性指数表现各不相同,品系13个性状的变异系数大于10.00%,地方品种11个性状、选育品种12个性状的变异系数大于10.00%,其中空粒数的变异系数在3类种质中均是最大的,说明空粒数具有较丰富的遗传变异。地方品种的剑叶长度及株高等11个性状的遗传多样性指数在3类种质中最大,说明本研究中219份水稻地方品种的剑叶长度及株高等11个性状的遗传背景比较宽泛,遗传多样性较丰富;选育品种的3个生育期性状、有效穗数及谷粒宽度等9个性状的遗传多样性指数在3类种质中最大,说明选育品种在生育期、产量及稻米品质等方面遗传背景比较宽泛,具有较丰富的遗传多样性,这与水稻在驯化过程中的人工选择密不可分[

参考文献 28
百度学术    
28]。品系19个性状的遗传多样性指数在3类种质中均最小,遗传多样性水平较低,其原因可能是品种改良过程中性状单一化所致。

3.2 水稻种质资源表型性状综合评价

据统计,我国保存的水稻种质资源已逾10万份,但是水稻表型性状众多,如何高效、精准且规模化地鉴定水稻种质资源是水稻育种急需解决的重要问题。本研究通过对20个农艺性状的相关性分析,发现149个相关系数达到极显著水平,说明这些性状之间存在着复杂的相互关系,这一结果与陈小龙等[

参考文献 29
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29]的研究结果基本一致。主成分分析结果表明,前6个主成分累积贡献率达79.309%,贡献率最大的为生育期性状,包括始穗期、抽穗期及齐穗期,其次为与产量相关的性状剑叶长宽比及有效穗数等,与谷粒相关的性状贡献率也较大,说明生育期、产量及谷粒性状是造成这些种质表型多样化的主要因素。通过聚类分析发现,1775份水稻种质资源被划分成3个类群,各类群种质的性状间存在明显差异。类群Ⅰ包含东北三省及北京和杭州,这类群种质的始穗期等生育期性状、与产量相关的性状如分蘖数及有效穗数等10个性状的遗传多样性较丰富,可为今后水稻种质资源创新及新品种选育提供优异种质。第Ⅱ类群仅包含宁夏,说明宁夏种质资源与其他省(市)种质资源的亲缘关系较远,因此,应加大对宁夏种质的利用率,以拓宽水稻种质资源遗传基础。第Ⅲ类群包含河北、山东、云南、江苏及新疆,此类群种质谷粒长度的遗传多样性指数在3个类群中最大,说明这些种质的谷粒长度具有较丰富的多样性,可为今后水稻品质育种提供丰富的种质。

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