2023, 24(2):523-531.DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20220830003
摘要:采用14对SSR引物对江西省9个枫香古树群体的222个单株进行毛细管电泳测序,利用GenAIEx、CERVUS和Structure软件,进行遗传多样性与聚类分析。结果表明14个SSR位点平均观测等位基因数(Na)为8.143个,平均有效等位基因数(Ne)为2.819个,Shannon信息指数(I)平均值为1.009,平均期望杂合度(He)和观测杂合度(Ho)分别为0.504和0.470,多态信息含量(PIC)平均值为0.513。宁都(ND)群体具有最高的遗传多样性(He=0.551),湾里(WL)群体的遗传多样性最低(He=0.394)。在地区水平,赣南(He=0.534,n=8)和赣北(He=0.505,n=14)地区具有较高的遗传多样性和特有等位基因;赣中地区具有最低的遗传多样性(He=0.473)和最少的特有等位基因(n=2)。分子方差分析(AMOVA)结果表明枫香群体内变异为92%,显著高于群体间变异8%,与遗传分化系数(Fst=0.133)一致,有可能是较高的基因流造成的(Nm=2.995)。主成分分析和聚类分析表明9个群体可分成3大类群,不同枫香古树群体间存在较为强烈的基因渐渗。研究结果为枫香古树的利用及保护提供科学依据,在今后的枫香育种工作中,要加强对枫香古树个体的保护,可以加强在赣北、赣南地区群体内开展优树选择,有可能含有特定的基因类型资源,可以获得更大的遗传增益。
胡永超, 马 洁, 唐建宁, 朱金忠, 杨 涓, 郑 蕊, 张 磊, 郑国琦
2022, 23(3):755-767.DOI: 10.13430/j.cnki.jpgr.20211105001
摘要:通过对 43 份枸杞材料进行表型性状指标的测定,结合 SSR 分子标记技术,综合分析枸杞古树与现有宁夏枸杞品种(系)之间的群体结构和遗传多样性。表型性状主成分分析结果确定了主成分为 4,累计贡献率达到 78.09%,第一主成分叶片大小和第二主成分果实大小起主要贡献作用。样品变异系数范围为 15%~54%,平均值为 26.78%,样品遗传变异指数范围为5.26~5.41。表型性状指标通过聚类分析后分为 4 个类群,第Ⅰ类群 3 份材料,第Ⅱ类群 3 份材料,第Ⅲ类群 8 份材料,第Ⅳ类群29 份材料。采用隶属函数法分析确定综合性状优良的 5 个材料,分别为 L14、 L16、L28、L40、L43。SSR 分子标记遗传信息有效等位基因平均值为 2.018,期望杂合度平均值为 0.398,Shannon′s 指数平均值为 0.839。SSR 分子标记确定最优 K 值为 4,综合评价较好的 5 份材料中,L16 表现为杂合基因型,L14、L28、L40、L43 表现为单一基因型。本研究运用多种方法综合分析了不同来源、不同树龄枸杞古树的表型性状差异和遗传多样性,为后续枸杞古树种质资源的利用及枸杞品种选育提供了理论依据和实践指导。