采用RAPD分子标记结合形态学指标对43份石刁柏种质资源的遗传多样性进行评价。田间试验相关分析表明，茎粗、林高、茎数与产量呈极显著正相关，三者是影响石刁柏产量的主要因素。茎粗、株高、产量与一级笋率呈显著正相关。花梗全紫的石刁柏一级笋率相对较高。根据形态学指标将材料分为7大类。在分子标记中，从60个随机引物中筛选出12个能产生清晰、稳定可重复DNA片段的引物，对供试材料进行RAPD扩增。在供试材料中共获得183条扩增产物，产生的DNA片段大小主要分布在200～1600bp之间，其中170条具有遗传多态性，约占总数的92．92％。各基因型间的Nei氏相似性系数分布在0．407～0．931之间，平均相似性为0．765，可见石刁柏各基因型之间的遗传多态性较为丰富。经UPGMA方法建立的树状图，可将参试品种划分为8大类群。形态学指标与遗传多样性指标的相关分析结果显示：分枝节间距、花梗颜色、每簇拟叶数、最长分枝长度、茎粗5个形态学指标与遗传多样性指标之间存在一定的相关性。