以PCR产物直接测序分析了侧耳属（Pleurotus）27个种41个茵株的nLSU rDNA序列，以Hohenbuehelia serotina和Lentinula edodes为外群，运用MEGA3．1软件中的邻接法（neighbor—joining）和最大简约法（maximums parsimony）分别构建侧耳属的系统发育树。分子系统发育树表明：Coremiopleurotus组和Pleurotus属内单、二系茵丝系统均为多系起源；P．rattenburyi，刺芹侧耳种族群（P．eryngii species—complex）与被划分在Lepiotarii组的栎侧耳P．dryinus能与侧耳属其他成员明显分开；红侧耳P．djamor、桃红侧耳P．salmoneostramineus、扇形侧耳P．flabellatus与贝盖侧耳P．calyptratus关系密切；金顶侧耳P．citrinopileatus与P．euosmus聚在一起，而与黄白侧耳P．conucopiae为不同的分类单元；肺形侧耳P．pulmonarius与P．abieticale亲缘关系较近。