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首页 > 过刊浏览>2012年第13卷第3期 >429-434. DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.2012.03.017 优先出版
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大蒜种质产量和品质性状主成分聚类分析与综合评价
DOI:
10.13430/j.cnki.jpgr.2012.03.017
CSTR:
作者:
  • 陈书霞

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作者单位:

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通讯作者:

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基金项目:

国家自然科学基金项目(面上项目)


Cluster Analysis and Evaluation of Garlic(Allium sativum L.)Germplasm Based on Principal Components
Author:
  • chenshuxia

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    摘要:

    以40个大蒜品种为供试材料,依据数值分类学的性状选择原则,分别于大蒜生长期和采收后进行农艺性状指标的采集。估算40个大蒜品种16个农艺性状及4个品质指标的主成分,并以前3个主成分和遗传相似性系数为基础,分别作二维散点图和系统聚类分析。40份大蒜品种前7个主成分累计贡献率达85%。根据品种性状主成分表现,评选出性状优良的大蒜品种共10个。在聚类图中,在0.12的遗传相似性水平上可以把40份品种分成4类,即1个由33个品种聚成的类群Ⅰ和包含了四份种质的类群Ⅱ、仅含一份种质的类群Ⅲ和包含两份外来种质的类群Ⅳ,全部种质的遗传相似性系数在0.07~0.64之间,很好地揭示了品种类群间存在的亲缘关系。

    关键词:大蒜; 主成分; 聚类分析
    Abstract:

    The agronomy traits indexes of 40 garlic cultivars were Investigated based on the principal of numerical classification, and the PCA of 16 agronomy traits and 5 quality indexes were analyzed, the scatter plot were drawed based on the first 3 PC and the clustering were carried out based on the genetic coefficient. The first 7 PC accounted for 85% variation among the cultivars. The 10 excellent cultivars were selected based on the principal component. The 40 cultivars can be classified into 4 groups when SM coefficient was 0.12 on the UPGMA dendrogram. The clustering based on the 0.07~0.64 SM coefficient explained the genetic relationship of 40 cultivars.

    Key words:Garlic; Principal components; Cluster analysis
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陈书霞,常燕霞,程智慧,等.大蒜种质产量和品质性状主成分聚类分析与综合评价[J].植物遗传资源学报,2012,13(3):429-434.

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  • 收稿日期:2011-10-02
  • 最后修改日期:2011-11-23
  • 录用日期:2012-03-13
  • 在线发布日期: 2012-04-13
  • 出版日期:
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