2025年5月24日 7:01 星期六
  • 网站首页
  • 期刊简介
  • 投稿指南
    投稿指南
    论文模版
    著作权许可及转让声明
  • 编委会
    植物遗传资源学报编委会
    青年编委
    主编简介
  • OA政策
    OA政策
    情况通报
    高被引论文
  • 出版伦理
    出版伦理声明
  • 遗传资源分会
    遗传资源分会简介
    委员会
    活动公告
    成为会员
  • 欢迎订阅
  • 联系我们
  • English
  • 微信公众号
首页 > 过刊浏览>2025年第26卷第1期 >189-201. DOI:10.13430/j.cnki.jpgr.20240310001 优先出版
PDF HTML阅读 XML下载 导出引用 引用提醒
基于RNA-seq番石榴果实软化候选基因的挖掘及表达分析
DOI:
10.13430/j.cnki.jpgr.20240310001
CSTR:
作者:
  • 范競升 1

    范競升

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 马松琼 1

    马松琼

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 宁琳 1

    宁琳

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 何江 1

    何江

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 陈念 2

    陈念

    南宁市农业科学研究所,南宁 530021
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 欧景莉 1

    欧景莉

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 陈豪军 1

    陈豪军

    广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • 陈丹 3

    陈丹

    广西农业职业技术大学农业工程学院,南宁 530007
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
作者单位:

1.广西壮族自治区亚热带作物研究所/广西亚热带特色水果质量安全控制重点实验室,南宁 530001;2.南宁市农业科学研究所,南宁 530021;3.广西农业职业技术大学农业工程学院,南宁 530007

作者简介:

研究方向为果树种质资源研究及遗传育种,E-mail: jingshengfan@yeah.net

通讯作者:

陈丹,研究方向为农业生态,E-mail: ddan55@126.com

中图分类号:

基金项目:

广西农业科学院基本科研业务专项(桂农科2023YM123,桂农科2021YT146)


Mining and Expression Analysis of Softening Candidate Genes in Guava Fruit Based on RNA-seq
Author:
  • FAN Jingsheng 1

    FAN Jingsheng

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • MA Songqiong 1

    MA Songqiong

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • NING Lin 1

    NING Lin

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • HE Jiang 1

    HE Jiang

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • CHEN Nian 2

    CHEN Nian

    Nanning Institute of Agricultural Sciences,Nanning 530021
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • OU Jingli 1

    OU Jingli

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • CHEN Haojun 1

    CHEN Haojun

    Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
  • CHEN Dan 3

    CHEN Dan

    College of Agricultural Engineering, Guangxi Vocational University of Agriculture, Nanning 530007
    在期刊界中查找
    在百度中查找
    在本站中查找
Affiliation:

1.Guangxi Subtropical Crops Research Institute/Guangxi Key Laboratory of Quality and Safety Control for Subtropical Fruits,Nanning 530001;2.Nanning Institute of Agricultural Sciences,Nanning 530021;3.College of Agricultural Engineering, Guangxi Vocational University of Agriculture, Nanning 530007

Fund Project:

Basic Scientific Research Projects of Guangxi Academy of Agricultural Sciences (Guinongke2023YM123,Guinongke2021YT146)

  • 摘要
  • |
  • 图/表
  • |
  • 访问统计
  • |
  • 参考文献
  • |
  • 相似文献
  • |
  • 引证文献
  • |
  • 资源附件
  • |
  • 文章评论
    摘要:

    番石榴变种丰富,不同品种的果实质地差异较大。果实的软化程度决定了其食用口感、运输贮藏及货架期等商品价值。为探究影响番石榴果实质地软化的调控基因,本研究比较了酥脆品种粉红蜜与软肉品种西瓜2号果实在坚熟期与软熟期的转录组。结果表明,软熟期品种间差异表达基因数目最多,GO注释显示差异基因主要富集在结合活性和催化活性等分子功能中,KEGG代谢通路分析显示差异基因主要富集在光合作用、光合作用天线蛋白、半乳糖代谢和植物激素信号转导途径。两个品种在软熟期果实质地的差异与细胞壁代谢途径、木质素生物合成途径、植物激素代谢基因和转录因子的调控密切相关。J3R85008159_PG和J3R85010291_XTH的上调表达是促进番石榴软化的重要因素。J3R85010291_TCH4可能通过降低细胞壁的机械强度调控果实软化。木质素合成途径基因(J3R8506005_CAD、J3R8502863_POD、J3R8507303_POD、J3R8500836_LAC和J3R8507803_LAC)的下调表达延缓木质素的积累,促进果实软化。ABA途径调控基因(PYL和SnRK2)、乙烯途径调控基因(ETR/ERS、EBF1/2、 EIN3)和相关转录因子家族基因(J3R85017767_MYB、J3R85004770_MYB、J3R85004060_NAC、J3R85006932_NAC、J3R85012461_ERF 、J3R85010726_bHLH、J3R85003109_bHLH、J3R85014989_bHLH、J3R85015176_WRKY、J3R85014001_WRKY、J3R85014684_WRKY、J3R85010736_WRKY)可能协同调控细胞壁代谢基因的表达从而影响番石榴软化过程。

    关键词:番石榴;果实质地;转录组;候选基因
    Abstract:

    Guava variants are abundant and fruit texture varies considerably between varieties. The softening degree of fruit determines its edible taste, transportation, storage and shelf life and other commodity values. In order to explore the regulatory genes affecting the texture softening of guava fruit, transcriptomic sequencing was performed on two cultivars,Fenhongmi(crisp)and Xigua No.2(soft)at the firm ripening stage and soft ripening stage. The results showed that the number of differentially expressed genes was the highest among two varieties at soft maturity stage. GO annotation showed that differentially expressed genes were mainly enriched in molecular functions such as binding activity and catalytic activity, and KEGG metabolic pathway analysis showed that differentially expressed genes were mainly enriched in photosynthesis, photosynthetic antenna protein, galactose metabolism and plant hormone signal transduction pathways. The difference of texture of the two varieties in soft ripening stage is closely related to the regulation of cell wall metabolism, lignin biosynthesis pathway, plant hormone metabolism genes and transcription factors. The up-regulated expression of J3R85008159_PG and J3R85010291_XTH is an important factor promoting the softening of guava. J3R85010291_TCH4 may regulate fruit softening by reducing the mechanical strength of cell wall. Down-regulated expression of lignin synthesis pathway genes (J3R8506005_CAD, J3R8502863_POD, J3R8507303_POD, J3R8500836_LAC and J3R8507803_LAC) delayed lignin accumulation and promoted fruit softening. ABA pathway regulatory genes (PYL and SnRK2), ethylene pathway regulatory genes (ETR/ ERS, EBF1/2, EIN3) and related transcription factor family genes (J3R85017767_MYB、J3R85004770_MYB、J3R85004060_NAC、J3R85006932_NAC、J3R85012461_ERF 、J3R85010726_bHLH、J3R85003109_bHLH、J3R85014989_bHLH、J3R85015176_WRKY、J3R85014001_WRKY、J3R85014684_WRKY、J3R85010736_ WRKY) may synergistic regulate the expression of cell wall metabolic genes and thus affect the softening process of guava.

    Key words:Psidium guajava L.;fruit texture;transcriptome;candidate genes
    参考文献
    相似文献
    引证文献
引用本文

范競升,马松琼,宁琳,等.基于RNA-seq番石榴果实软化候选基因的挖掘及表达分析[J].植物遗传资源学报,2025,26(1):189-201.

复制
分享

微信扫一扫:分享

微信里点“发现”,扫一下

二维码便可将本文分享至朋友圈。

文章指标
  • 点击次数:
  • 下载次数:
  • HTML阅读次数:
  • 引用次数:
历史
  • 收稿日期:2024-03-10
  • 最后修改日期:
  • 录用日期:
  • 在线发布日期: 2025-01-07
  • 出版日期:
文章二维码
您是第位访问者
ICP:京ICP备09069690号-23
京ICP备09069690号-23
植物遗传资源学报 ® 2025 版权所有
技术支持:北京勤云科技发展有限公司
请使用 Firefox、Chrome、IE10、IE11、360极速模式、搜狗极速模式、QQ极速模式等浏览器,其他浏览器不建议使用!